215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2377 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_2377  chromosome partitioning ATPase  100 
 
 
346 aa  719    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.0000000329135  unclonable  0.0000000236411 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0397  ATPase domain-containing protein  23.58 
 
 
349 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0991  ATPase domain-containing protein  26.75 
 
 
360 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.440755  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2581  ATPase domain protein  25.82 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000379448  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2633  ATPase  23.77 
 
 
340 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.839220000000001e-18  decreased coverage  0.0000000173501 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3749  ATPase domain-containing protein  25.72 
 
 
340 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000275778  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0187  ATPase  25.99 
 
 
339 aa  73.2  0.000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000236407  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3190  ATPase domain-containing protein  21.91 
 
 
359 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000797397  unclonable  0.000049795 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4106  ATPase domain-containing protein  26.18 
 
 
355 aa  67.8  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000114229  unclonable  0.0000000119877 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0439  ATPase  23.55 
 
 
340 aa  65.9  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000906876  unclonable  0.0000000000000120536 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.51 
 
 
338 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2258  ATPase domain protein  23.8 
 
 
360 aa  62.8  0.000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5555  plasmid partitioning protein RepA  29.59 
 
 
405 aa  62.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.661673 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9501  replication protein A  29.44 
 
 
405 aa  61.2  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.222629  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0093  hypothetical protein  23.44 
 
 
338 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000000492521  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.46 
 
 
354 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.48 
 
 
257 aa  58.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6317  plasmid partitioning protein RepA  27.55 
 
 
405 aa  57.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.42 
 
 
323 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.74 
 
 
277 aa  58.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.6 
 
 
261 aa  57.4  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.81 
 
 
255 aa  56.2  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  25.59 
 
 
265 aa  54.7  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.14 
 
 
313 aa  54.7  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.79 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.39 
 
 
265 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.62 
 
 
353 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4159  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.41 
 
 
258 aa  53.5  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3667  regulatory protein CII  24.06 
 
 
356 aa  53.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  22.18 
 
 
265 aa  53.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.49 
 
 
294 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0561  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.2 
 
 
254 aa  53.1  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.2767899999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.49 
 
 
294 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.18 
 
 
265 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1742  chromosome partitioning ATPase  27.68 
 
 
257 aa  52.4  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000936624  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.75 
 
 
268 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.12 
 
 
304 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5193  plasmid partitioning protein RepA  27.09 
 
 
397 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0372499  normal  0.16282 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.45 
 
 
259 aa  51.6  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  24.38 
 
 
265 aa  51.2  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.6 
 
 
273 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.77 
 
 
327 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3535  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.57 
 
 
276 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167999  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.42 
 
 
298 aa  51.2  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7093  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 
339 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2474  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.18 
 
 
294 aa  50.8  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.00522516  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4089  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.08 
 
 
398 aa  50.8  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.563893 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5463  plasmid partitioning protein RepA  26.6 
 
 
397 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.328009 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.64 
 
 
265 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  24.67 
 
 
268 aa  50.1  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.05 
 
 
265 aa  50.4  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.63 
 
 
472 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.36 
 
 
260 aa  50.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3212  chromosome partitioning protein parA  27.36 
 
 
260 aa  50.1  0.00006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.65 
 
 
322 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  25.95 
 
 
262 aa  49.7  0.00007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4541  chromosome segregation ATPase  23.68 
 
 
330 aa  49.7  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6017  plasmid partitioning protein RepA  28.43 
 
 
398 aa  49.7  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0237613  normal  0.19813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.21 
 
 
340 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0540093  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5408  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.9 
 
 
301 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4281  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.68 
 
 
407 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4543  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.89 
 
 
404 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.88 
 
 
252 aa  48.9  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4671  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.14 
 
 
397 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.89 
 
 
355 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146572 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2596  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.4 
 
 
251 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.711076  normal  0.122998 
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2938  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.96 
 
 
258 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 
313 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5912  plasmid partitioning protein RepA  26.5 
 
 
408 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.334298  normal  0.0281794 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39740  chromosome segregation ATPase  25 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.485566  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  28.08 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0058  putative ParA chromosome partitioning protein  26.78 
 
 
265 aa  48.1  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4166  chromosome segregation ATPase  25.79 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.86 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3589  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.68 
 
 
346 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.720492  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2197  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.83 
 
 
242 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000739548  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  22.49 
 
 
266 aa  47.8  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4517  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.65 
 
 
401 aa  47.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0048  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.38 
 
 
256 aa  47.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.627572  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0029  chromosome segregation ATPase  23.38 
 
 
256 aa  47.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.158889 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4774  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.37 
 
 
296 aa  47.8  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3276  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26 
 
 
410 aa  47.4  0.0003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.572814  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3037  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.88 
 
 
256 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2566  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.95 
 
 
282 aa  47.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.773766  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3561  plasmid partitioning protein RepA  27.4 
 
 
405 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0949194  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.93 
 
 
253 aa  47.4  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  23.98 
 
 
253 aa  47.4  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.63 
 
 
260 aa  47.4  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49030  hypothetical protein  22.11 
 
 
343 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000408552  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4954  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.64 
 
 
253 aa  47.4  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024691  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  23.6 
 
 
249 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.87 
 
 
408 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4907  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.1 
 
 
263 aa  47  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000134549  normal  0.16741 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.7 
 
 
270 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31920  chromosome segregation ATPase  24.18 
 
 
293 aa  47  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.61 
 
 
262 aa  47  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.36 
 
 
264 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5615  plasmid partitioning protein RepA  28.63 
 
 
408 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.967203  normal  0.199114 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.58 
 
 
253 aa  46.6  0.0006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.491233  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  24.39 
 
 
256 aa  46.6  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>