More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_0439 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_0439  ATPase  100 
 
 		 340 aa  702    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000906876  unclonable  0.0000000000000120536 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2633  ATPase  85 
 
 		 340 aa  588  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.839220000000001e-18  decreased coverage  0.0000000173501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0093  hypothetical protein  70.45 
 
 		 338 aa  494  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000000492521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0187  ATPase  61.42 
 
 		 339 aa  448  1e-125  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000236407  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2258  ATPase domain protein  35.9 
 
 		 360 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4106  ATPase domain-containing protein  37.32 
 
 		 355 aa  211  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000114229  unclonable  0.0000000119877 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3749  ATPase domain-containing protein  36.44 
 
 		 340 aa  209  4e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000275778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0397  ATPase domain-containing protein  34.73 
 
 		 349 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2581  ATPase domain protein  33.74 
 
 		 339 aa  171  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000379448  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0991  ATPase domain-containing protein  34.67 
 
 		 360 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.440755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3190  ATPase domain-containing protein  32.72 
 
 		 359 aa  155  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000797397  unclonable  0.000049795 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2377  chromosome partitioning ATPase  23.55 
 
 		 346 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.0000000329135  unclonable  0.0000000236411 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31363  predicted protein  25.1 
 
 		 426 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0616493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.53 
 
 		 255 aa  65.1  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.11 
 
 		 303 aa  64.7  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3714  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.54 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.13 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  32.43 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2886  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.47 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.23 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.76 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.46 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.27 
 
 		 257 aa  58.9  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.72 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.29 
 
 		 258 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758979  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  27.6 
 
 		 279 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2412  ParA family protein  25.12 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0479  putative sporulation initiation inhibitor protein Soj  26.67 
 
 		 279 aa  57.4  0.0000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.79 
 
 		 300 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2041  putative chromosome partitioning protein ParA, ATPase  25.76 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93461  normal  0.236522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.98 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  26.46 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.78 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.78 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.61 
 
 		 472 aa  56.2  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.4 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.88 
 
 		 263 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.897303 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0237  chromosome partitioning ATPase  25.64 
 
 		 279 aa  55.8  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0052  sporulation initiation inhibitor protein Soj family protein  30.32 
 
 		 323 aa  55.1  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5120  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.37 
 
 		 257 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4637  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.08 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.94 
 
 		 298 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.49 
 
 		 255 aa  54.7  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6545  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.26 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952996  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.87 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.65 
 
 		 297 aa  54.7  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.33 
 
 		 256 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.24 
 
 		 255 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22160  chromosome partitioning ATPase  28.65 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.1 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.28 
 
 		 264 aa  54.3  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.21 
 
 		 330 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.76 
 
 		 254 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3948  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.41 
 
 		 316 aa  54.7  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.056511 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5070  ParA family protein  24.01 
 
 		 257 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2156  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.65 
 
 		 337 aa  53.9  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.371685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5376  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.83 
 
 		 443 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00931432  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.64 
 
 		 263 aa  53.5  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.29 
 
 		 257 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.14 
 
 		 258 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992833  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2752  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.79 
 
 		 262 aa  53.5  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.32 
 
 		 313 aa  53.5  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.46 
 
 		 338 aa  53.5  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.77 
 
 		 254 aa  53.1  0.000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.7 
 
 		 265 aa  53.1  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.42 
 
 		 303 aa  53.1  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  23.3 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.73 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.58 
 
 		 256 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.26 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.8 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3761  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.27 
 
 		 261 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.242844  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4754  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.08 
 
 		 302 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1104  replication protein RepA  28.42 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000233941  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4943  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.84 
 
 		 257 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45160  hypothetical protein  23.41 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4532  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.03 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1202  replication protein RepA  28.42 
 
 		 397 aa  52  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0606445  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4105  chromosome segregation ATPase  27.13 
 
 		 253 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000593766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4678  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.76 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.993482  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.68 
 
 		 350 aa  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.11 
 
 		 408 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.21 
 
 		 268 aa  51.6  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8703  plasmid partitioning protein RepA  29.41 
 
 		 403 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9800  replication protein A  29.73 
 
 		 409 aa  51.6  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4010  chromosome segregation ATPase  25.79 
 
 		 266 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0588061 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0576  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.82 
 
 		 314 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  27.32 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0744  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.79 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000594465  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.11 
 
 		 249 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4023  ATPase, ParA type  28.49 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.845906  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.8 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.92 
 
 		 259 aa  50.8  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  27.14 
 
 		 255 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4159  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.26 
 
 		 258 aa  50.8  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1723  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30 
 
 		 256 aa  50.8  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0022  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.63 
 
 		 257 aa  50.8  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.695943  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.77 
 
 		 262 aa  50.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0475444  hitchhiker  0.00000632397 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3976  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.45 
 
 		 316 aa  50.4  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0294413  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.32 
 
 		 254 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>