118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0397 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0397  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 349 aa  724    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4106  ATPase domain-containing protein  43.59 
 
 		 355 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000114229  unclonable  0.0000000119877 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0187  ATPase  33.81 
 
 		 339 aa  190  2.9999999999999997e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000236407  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2581  ATPase domain protein  35.24 
 
 		 339 aa  189  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000379448  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2633  ATPase  34.75 
 
 		 340 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.839220000000001e-18  decreased coverage  0.0000000173501 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0439  ATPase  34.73 
 
 		 340 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000906876  unclonable  0.0000000000000120536 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2258  ATPase domain protein  33.24 
 
 		 360 aa  180  4e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0991  ATPase domain-containing protein  33.94 
 
 		 360 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.440755  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3190  ATPase domain-containing protein  33.84 
 
 		 359 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000797397  unclonable  0.000049795 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0093  hypothetical protein  31.91 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000000492521  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3749  ATPase domain-containing protein  32.38 
 
 		 340 aa  161  2e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000275778  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2377  chromosome partitioning ATPase  23.58 
 
 		 346 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.0000000329135  unclonable  0.0000000236411 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.92 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.89 
 
 		 327 aa  66.2  0.0000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1214  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.27 
 
 		 330 aa  65.9  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.36 
 
 		 265 aa  65.5  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.78 
 
 		 254 aa  62.8  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3714  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.8 
 
 		 281 aa  62.4  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.24 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.88 
 
 		 257 aa  60.1  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4943  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.25 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5765  hypothetical protein  24.88 
 
 		 255 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5070  ParA family protein  25.25 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2041  putative chromosome partitioning protein ParA, ATPase  27.78 
 
 		 254 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93461  normal  0.236522 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.03 
 
 		 338 aa  58.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5120  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.25 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  24.5 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.5 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.25 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.25 
 
 		 257 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.87 
 
 		 254 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.97066  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.87 
 
 		 254 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19577 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6545  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.13 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952996  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  24.38 
 
 		 255 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  24.14 
 
 		 365 aa  56.2  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  27.14 
 
 		 279 aa  55.8  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.71 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.75 
 
 		 256 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.88 
 
 		 254 aa  54.7  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2412  ParA family protein  25.93 
 
 		 263 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.88 
 
 		 255 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.38 
 
 		 256 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1422  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 366 aa  53.5  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.482848  normal  0.726821 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.38 
 
 		 254 aa  53.1  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.88 
 
 		 323 aa  52.8  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3504  chromosome segregation ATPase  25.24 
 
 		 257 aa  52.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.25082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.12 
 
 		 254 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.12 
 
 		 254 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4694  chromosome segregation ATPase  26.7 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0801275  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.4 
 
 		 258 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.4 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758979  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2785  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.38 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45160  hypothetical protein  24.39 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1454  ParA family protein  27.14 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00493427  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.83 
 
 		 340 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.36 
 
 		 254 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49030  hypothetical protein  24.09 
 
 		 343 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000408552  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.46 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.897303 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4486  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.88 
 
 		 340 aa  50.1  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0540093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23420  chromosome segregation ATPase  24.17 
 
 		 315 aa  49.7  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3355  chromosome segregation ATPase  24.29 
 
 		 268 aa  49.3  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.98 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  23.58 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5082  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.64 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.161986 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0987  partition protein, ParA-like  23.96 
 
 		 299 aa  48.5  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.000325119  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.31 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  23.58 
 
 		 255 aa  47.4  0.0004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.32 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0014  putative ParA-like (IncC) ATPase  25.58 
 
 		 294 aa  46.6  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.118002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1849  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.55 
 
 		 300 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5376  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.64 
 
 		 443 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00931432  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  34.12 
 
 		 258 aa  45.4  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3772  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.96 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.507747  normal  0.14753 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1355  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.86 
 
 		 281 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00367255  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2988  sporulation initiation inhibitor protein soj  25.24 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2666  sporulation initiation inhibitor protein soj  25.24 
 
 		 257 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.71 
 
 		 366 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31363  predicted protein  21.6 
 
 		 426 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0616493  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2506  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 272 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2856  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.99 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.225227 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4862  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.39 
 
 		 317 aa  44.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0229675  normal  0.0133431 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0051  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.42 
 
 		 261 aa  44.3  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0497583  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4978  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.88 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3326  putative chromosome partitioning protein PARA  37.5 
 
 		 261 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00529695  normal  0.207429 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.62 
 
 		 294 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2334  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.51 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2878  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.49 
 
 		 277 aa  43.9  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.504433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.9 
 
 		 249 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.54 
 
 		 262 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.7 
 
 		 286 aa  44.3  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  25.37 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.88 
 
 		 262 aa  43.5  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2664  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.37 
 
 		 273 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.166476  normal  0.327005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3457  chromosome partitioning protein ParA  25.33 
 
 		 268 aa  43.5  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3521  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.35 
 
 		 261 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000641788 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3196  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.35 
 
 		 261 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0833  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  47.17 
 
 		 350 aa  43.5  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0651125  hitchhiker  0.0000101821 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2816  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.5 
 
 		 260 aa  43.5  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.317638  normal  0.393474 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>