130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3749 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3749  ATPase domain-containing protein  100 
 
 		 340 aa  710    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000275778  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2581  ATPase domain protein  36.26 
 
 		 339 aa  232  9e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000379448  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2258  ATPase domain protein  38.86 
 
 		 360 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0439  ATPase  36.44 
 
 		 340 aa  209  4e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000906876  unclonable  0.0000000000000120536 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0187  ATPase  35.31 
 
 		 339 aa  202  9e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000236407  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2633  ATPase  34.4 
 
 		 340 aa  198  9e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.839220000000001e-18  decreased coverage  0.0000000173501 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0093  hypothetical protein  34.12 
 
 		 338 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000000492521  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4106  ATPase domain-containing protein  33.24 
 
 		 355 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000114229  unclonable  0.0000000119877 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0991  ATPase domain-containing protein  31.18 
 
 		 360 aa  163  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.440755  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0397  ATPase domain-containing protein  32.38 
 
 		 349 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3190  ATPase domain-containing protein  31.36 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000797397  unclonable  0.000049795 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2377  chromosome partitioning ATPase  25.72 
 
 		 346 aa  75.1  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.0000000329135  unclonable  0.0000000236411 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.71 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758979  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.78 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.897303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.88 
 
 		 265 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.37 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2412  ParA family protein  28.78 
 
 		 263 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.71 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31363  predicted protein  22.41 
 
 		 426 aa  60.5  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0616493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.36 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0855  ParA family protein  26.32 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4507  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.11 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.94 
 
 		 259 aa  58.2  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0025  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.79 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2287  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.98 
 
 		 366 aa  56.6  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.12 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.74 
 
 		 259 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3714  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.13 
 
 		 281 aa  54.7  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.76 
 
 		 254 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  31 
 
 		 472 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2374  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.64 
 
 		 306 aa  53.5  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.448364  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  26.47 
 
 		 255 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.21 
 
 		 298 aa  53.1  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  25.53 
 
 		 279 aa  52.8  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25370  chromosome partitioning ATPase  25.9 
 
 		 332 aa  52  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.401213 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2041  putative chromosome partitioning protein ParA, ATPase  25 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93461  normal  0.236522 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5765  hypothetical protein  25.62 
 
 		 255 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1555  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.57 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.88 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1422  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.81 
 
 		 366 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.482848  normal  0.726821 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1454  ParA family protein  25.12 
 
 		 258 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00493427  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  25.25 
 
 		 259 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2181  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.84 
 
 		 306 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.000966803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.98 
 
 		 256 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4943  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.64 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.24 
 
 		 330 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5070  ParA family protein  24.64 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5120  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.64 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.64 
 
 		 257 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0988  regulatory protein CII  24.3 
 
 		 343 aa  50.1  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.26 
 
 		 256 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  22.36 
 
 		 323 aa  49.7  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.21 
 
 		 263 aa  49.7  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  23.28 
 
 		 256 aa  48.5  0.0001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.63 
 
 		 338 aa  48.1  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5246  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.24 
 
 		 299 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.717925 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2993  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.55 
 
 		 302 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.504327  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2785  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.75 
 
 		 254 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0006  ParA family protein  25.51 
 
 		 258 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0843826  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5429  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.73 
 
 		 322 aa  47.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11094  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1916  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.11 
 
 		 307 aa  47.8  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.374804  hitchhiker  0.00135404 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4779  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.24 
 
 		 299 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0862255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1849  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.57 
 
 		 300 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933483  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45160  hypothetical protein  26.11 
 
 		 256 aa  47.4  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1125  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.91 
 
 		 327 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.953549  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0670  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.64 
 
 		 300 aa  47  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.26 
 
 		 254 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49030  hypothetical protein  25.87 
 
 		 343 aa  47  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000408552  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.26 
 
 		 254 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.58 
 
 		 270 aa  46.6  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1728  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.18 
 
 		 273 aa  46.6  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19910  chromosome partitioning ATPase  22.19 
 
 		 293 aa  46.6  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1267  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.92 
 
 		 293 aa  46.6  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.27 
 
 		 254 aa  46.2  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3667  regulatory protein CII  22.3 
 
 		 356 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.368838 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.03 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1931  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  22.59 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.741466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.21 
 
 		 303 aa  45.8  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1240  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.82 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.345121  normal  0.555193 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2493  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.57 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.945625  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.42 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 		 255 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2844  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.62 
 
 		 268 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006578  pBT9727_0047  replication-associated protein  25.21 
 
 		 288 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.63 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  22.22 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  26.47 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.77 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.15 
 
 		 303 aa  44.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1925  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.4 
 
 		 307 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2820  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.91 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.217261  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3138  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.67 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0284667  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.65 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5440  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.28 
 
 		 263 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.28 
 
 		 263 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  25.91 
 
 		 254 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.63 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0188  chromosome partitioning protein ParA  23.61 
 
 		 260 aa  45.1  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0307  hypothetical protein  26.37 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.285877 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0987  partition protein, ParA-like  23.71 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.000325119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>