More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2633 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2633  ATPase  100 
 
 		 340 aa  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  4.839220000000001e-18  decreased coverage  0.0000000173501 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0439  ATPase  85 
 
 		 340 aa  609  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  unclonable  0.00000000906876  unclonable  0.0000000000000120536 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0093  hypothetical protein  68.64 
 
 		 338 aa  491  9.999999999999999e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.000000000492521  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0187  ATPase  59.64 
 
 		 339 aa  437  1e-121  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  unclonable  0.000000236407  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4106  ATPase domain-containing protein  37.71 
 
 		 355 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000114229  unclonable  0.0000000119877 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2258  ATPase domain protein  34.47 
 
 		 360 aa  211  1e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3749  ATPase domain-containing protein  34.69 
 
 		 340 aa  209  8e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000275778  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0397  ATPase domain-containing protein  34.75 
 
 		 349 aa  196  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2581  ATPase domain protein  35.03 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000379448  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3190  ATPase domain-containing protein  32.59 
 
 		 359 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000797397  unclonable  0.000049795 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0991  ATPase domain-containing protein  32.92 
 
 		 360 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.440755  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2377  chromosome partitioning ATPase  25 
 
 		 346 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.0000000329135  unclonable  0.0000000236411 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31363  predicted protein  25.94 
 
 		 426 aa  72.8  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0616493  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0688  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.85 
 
 		 303 aa  67  0.0000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.699038  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2886  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.71 
 
 		 264 aa  65.5  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.375362  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2412  ParA family protein  26.07 
 
 		 263 aa  63.5  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1920  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 258 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758979  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2723  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.52 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00040407  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1943  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.5 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2836  chromosome partitioning ATPase  28.65 
 
 		 279 aa  62.4  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0103983  normal  0.469261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3714  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.05 
 
 		 281 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2229  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.38 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0390819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1068  cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.27 
 
 		 255 aa  60.8  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0950  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1464  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.69 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3283  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.64 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  0.897303 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0193  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.61 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2028  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.19 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.421351  normal  0.576485 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2041  putative chromosome partitioning protein ParA, ATPase  26.4 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.93461  normal  0.236522 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2049  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.64 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.992833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0013  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.02 
 
 		 257 aa  58.5  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.690723  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4637  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.93 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4495  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.75 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1301  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.23 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2019  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.19 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4741  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.11 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.26 
 
 		 261 aa  56.2  0.0000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66480  hypothetical protein  27.96 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1579  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.4 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.26021  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2748  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.84 
 
 		 313 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.815603 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5765  hypothetical protein  27.96 
 
 		 255 aa  55.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2565  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.63 
 
 		 330 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6545  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.4 
 
 		 254 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.952996  normal  0.751795 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2785  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 254 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.680365 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0442  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.41 
 
 		 256 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0441  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.24 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.000000000798578  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4822  cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.19 
 
 		 408 aa  54.7  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0379935  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2299  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.36 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315391  normal  0.0688217 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0920  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.24 
 
 		 314 aa  53.9  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.0000000000171601  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0553  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.01 
 
 		 256 aa  53.9  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000721954 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4233  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28 
 
 		 330 aa  53.9  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007411  Ava_A0022  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  30.98 
 
 		 257 aa  53.5  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.695943  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4159  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.85 
 
 		 258 aa  53.5  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2160  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.96 
 
 		 254 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0987  partition protein, ParA-like  26.05 
 
 		 299 aa  53.1  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.000325119  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2774  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.96 
 
 		 254 aa  53.1  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0396  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23 
 
 		 257 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2285  putative chromosome segregation protein  28.42 
 
 		 255 aa  52.8  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3948  cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.92 
 
 		 316 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.056511 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5090  ParA family protein  23.58 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1320  chromosome segregation ATPase  28.65 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5120  cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.11 
 
 		 257 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.888866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0468  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.13 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1257  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22160  chromosome partitioning ATPase  26.44 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.057699  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1288  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  29.63 
 
 		 294 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.435318  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1649  ParA family protein  27.89 
 
 		 258 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5376  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.5 
 
 		 443 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00931432  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4104  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.05 
 
 		 397 aa  52.4  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.324179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5070  ParA family protein  23.11 
 
 		 257 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14080  chromosome partitioning ATPase  27.36 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0440  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.06 
 
 		 259 aa  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.912866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1555  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  29.79 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000476393 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4668  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25 
 
 		 255 aa  51.6  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016966  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1912  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.77 
 
 		 263 aa  51.6  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1728  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.93 
 
 		 273 aa  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1531  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  28.72 
 
 		 303 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.265392  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0002  ParA family protein  25.65 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.442351  hitchhiker  0.000159031 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4943  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  23.11 
 
 		 257 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2693  cobyrinic acid ac-diamide synthase  24.52 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19577 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2826  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.52 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.97066  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5304  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.65 
 
 		 263 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.301743  normal  0.0393048 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0014  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.56 
 
 		 256 aa  50.4  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386166  hitchhiker  0.000800579 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1531  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  28.21 
 
 		 299 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000837624 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2519  ParA family protein  27.18 
 
 		 257 aa  50.1  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000399076  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0541  cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.44 
 
 		 254 aa  49.7  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5608  ParA family protein  25.52 
 
 		 263 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5130  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.4 
 
 		 263 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1176  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.62 
 
 		 254 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.291287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0058  putative ParA chromosome partitioning protein  25.64 
 
 		 265 aa  49.7  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131132  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6104  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  24.52 
 
 		 254 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.381268 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0576  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  26.29 
 
 		 314 aa  49.7  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49030  hypothetical protein  28.17 
 
 		 343 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000408552  hitchhiker  0.0000000731371 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1442  chromosome partitioning ATPase  27.32 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.526471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3115  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  23.9 
 
 		 353 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.321925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1450  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  27.64 
 
 		 329 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00757148 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1822  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.71 
 
 		 300 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.17856  normal  0.132838 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  27.37 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5209  cobyrinic acid ac-diamide synthase  25.13 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0073  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  25.54 
 
 		 249 aa  49.3  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>