172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0029 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011206  Lferr_0030  Pyrrolo-quinoline quinone  100 
 
 
499 aa  1010  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.951716  normal  0.123126 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0029  tetrathionate hydrolase  100 
 
 
499 aa  1010  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0804  Pyrrolo-quinoline quinone  36.8 
 
 
536 aa  256  5e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05630  FOG: WD40-like repeat  27.91 
 
 
475 aa  141  3e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.687981  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0137  Pyrrolo-quinoline quinone  31.96 
 
 
481 aa  121  3e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1981  PQQ enzyme repeat protein  24.27 
 
 
509 aa  82.4  2e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1649  Pyrrolo-quinoline quinone  24.94 
 
 
486 aa  81.6  3e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000205987  normal  0.0168641 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3733  hypothetical protein  24.19 
 
 
1067 aa  79.3  1e-13  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.422005  normal  0.383912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4167  Pyrrolo-quinoline quinone  27.42 
 
 
432 aa  77  8e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3290  serine/threonine protein kinase  26.71 
 
 
963 aa  75.1  3e-12  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0556916 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1990  Pyrrolo-quinoline quinone  25.5 
 
 
463 aa  73.9  6e-12  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4514  Pyrrolo-quinoline quinone  25.87 
 
 
445 aa  70.9  5e-11  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  22.13 
 
 
652 aa  69.3  1e-10  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  7.86383e-06 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5123  Pyrrolo-quinoline quinone  26.42 
 
 
475 aa  69.3  1e-10  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.513174  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0262  Pyrrolo-quinoline quinone  24.25 
 
 
407 aa  69.7  1e-10  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  25 
 
 
2272 aa  68.9  2e-10  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3898  Pyrrolo-quinoline quinone  26.96 
 
 
423 aa  69.3  2e-10  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.122997  normal  0.375271 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  29.82 
 
 
774 aa  68.2  3e-10  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5726  WD40-like repeat-domain-containing protein  23.66 
 
 
901 aa  68.6  3e-10  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  22.41 
 
 
653 aa  67.8  4e-10  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  26.5 
 
 
1311 aa  66.6  1e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  20.4 
 
 
687 aa  65.9  2e-09  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1550  Pyrrolo-quinoline quinone  29.81 
 
 
809 aa  65.9  2e-09  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.183569  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0677  Pyrrolo-quinoline quinone  22.03 
 
 
431 aa  64.7  4e-09  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.350335  normal  0.177219 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0697  Pyrrolo-quinoline quinone  22.32 
 
 
415 aa  64.3  5e-09  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  25.09 
 
 
1241 aa  63.9  6e-09  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3300  serine/threonine protein kinase  25.23 
 
 
795 aa  63.2  1e-08  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0878  cobaltochelatase  24.82 
 
 
1812 aa  63.2  1e-08  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2694  Pyrrolo-quinoline quinone  25.07 
 
 
450 aa  62.8  2e-08  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  hitchhiker  0.00958514  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  25.6 
 
 
2036 aa  61.6  3e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3736  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.62 
 
 
392 aa  62  3e-08  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.550553  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1189  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.53 
 
 
393 aa  61.6  3e-08  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0343666  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1296  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.53 
 
 
393 aa  61.6  3e-08  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1156  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  22.34 
 
 
392 aa  61.2  5e-08  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00537914  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3085  Pyrrolo-quinoline quinone  21.37 
 
 
455 aa  60.8  5e-08  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00761305  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  31.38 
 
 
1300 aa  60.8  5e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0415  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.53 
 
 
393 aa  60.5  6e-08  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.873233  hitchhiker  0.00131878 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  25.6 
 
 
1969 aa  60.5  7e-08  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02404  protein assembly complex, lipoprotein component  22.34 
 
 
392 aa  60.5  7e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.005806  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2663  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.34 
 
 
392 aa  60.5  7e-08  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.27746e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02366  hypothetical protein  22.34 
 
 
392 aa  60.5  7e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0111233  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1165  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.34 
 
 
392 aa  60.5  7e-08  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.035422  normal  0.0264667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2796  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.34 
 
 
392 aa  60.5  7e-08  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.17492e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2664  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.07 
 
 
392 aa  59.3  2e-07  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.280231 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2251  PQQ enzyme repeat domain protein  30.43 
 
 
395 aa  58.2  3e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3006  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.52 
 
 
392 aa  58.5  3e-07  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.901484  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  21.65 
 
 
1328 aa  58.2  3e-07  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1899  Pyrrolo-quinoline quinone  30.43 
 
 
395 aa  58.2  3e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.70821 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2887  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  22.07 
 
 
392 aa  57.8  4e-07  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00225508  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0513  Pyrrolo-quinoline quinone  22.87 
 
 
422 aa  57.4  5e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0877  Pyrrolo-quinoline quinone  22.92 
 
 
797 aa  57.8  5e-07  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1962  Ig domain protein group 2 domain protein  22.46 
 
 
556 aa  57.8  5e-07  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0577426  normal  0.0531798 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1455  Pyrrolo-quinoline quinone  21.39 
 
 
1454 aa  57.4  6e-07  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0208  Pyrrolo-quinoline quinone  26.87 
 
 
1037 aa  57  8e-07  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.731734  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2189  Pyrrolo-quinoline quinone  23.73 
 
 
484 aa  56.2  1e-06  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.718843 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3526  Pyrrolo-quinoline quinone  24.19 
 
 
514 aa  56.2  1e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.103878  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1593  metallophosphoesterase  24.12 
 
 
611 aa  55.5  2e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.245606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4463  serine/threonine protein kinase  24.84 
 
 
820 aa  54.7  4e-06  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846265  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1712  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  25.6 
 
 
411 aa  54.3  5e-06  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.368  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1499  hypothetical protein  24.19 
 
 
384 aa  54.3  5e-06  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1484  hypothetical protein  23.92 
 
 
384 aa  54.3  5e-06  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3125  Pyrrolo-quinoline quinone  22.46 
 
 
444 aa  54.3  5e-06  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.687826 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02978  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  24.52 
 
 
402 aa  53.9  7e-06  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.373211  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  22.67 
 
 
698 aa  53.5  7e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2888  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  19.85 
 
 
392 aa  52.8  1e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.597931  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1643  Pyrrolo-quinoline quinone  21.38 
 
 
457 aa  53.1  1e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2671  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.86 
 
 
392 aa  52.4  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2714  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.86 
 
 
392 aa  52.4  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359129  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2777  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.86 
 
 
392 aa  52.4  2e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.985011  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3622  Pyrrolo-quinoline quinone  21.91 
 
 
422 aa  52  2e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3011  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.88 
 
 
393 aa  51.6  3e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2857  Pyrrolo-quinoline quinone  20.8 
 
 
387 aa  51.6  3e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.725617  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1114  Pyrrolo-quinoline quinone  21.82 
 
 
374 aa  51.6  3e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0348875  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1417  outer membrane assembly lipoprotein YfgL  27.57 
 
 
386 aa  51.2  4e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0124773 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0271  Pyrrolo-quinoline quinone  25.65 
 
 
445 aa  51.2  4e-05  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.943298 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3012  Pyrrolo-quinoline quinone  22.89 
 
 
382 aa  51.2  5e-05  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.345618  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  24.87 
 
 
619 aa  50.8  5e-05  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2758  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.58 
 
 
392 aa  50.8  5e-05  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.267883 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  24.68 
 
 
582 aa  50.8  6e-05  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3493  Pyrrolo-quinoline quinone  20.05 
 
 
461 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.546086 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1656  PQQ repeat-containing protein  23.78 
 
 
363 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0210  Pyrrolo-quinoline quinone  23.95 
 
 
397 aa  49.7  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1796  outer membrane protein  24.05 
 
 
497 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  5.80169e-08  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1786  Pyrrolo-quinoline quinone  21.53 
 
 
381 aa  48.9  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  25.58 
 
 
575 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1261  outer membrane protein assembly complex subunit YfgL  21.2 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21096  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0944  Pyrrolo-quinoline quinone  25.7 
 
 
448 aa  48.9  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2985  PQQ-dependent enzyme-like protein  23.35 
 
 
618 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.926915  normal  0.513639 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3153  hypothetical protein  19.88 
 
 
637 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0308733  normal  0.0661061 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1384  Pyrrolo-quinoline quinone  27.71 
 
 
612 aa  48.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.868816  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02746  polyvinylalcohol dehydrogenase  26.71 
 
 
561 aa  48.5  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1171  Pyrrolo-quinoline quinone  21.25 
 
 
399 aa  48.5  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0406546  normal  0.22444 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1615  Pyrrolo-quinoline quinone  21.8 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000904136 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06109  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 
400 aa  48.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01057  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 
400 aa  48.1  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.553657  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2290  Pyrrolo-quinoline quinone  22.5 
 
 
363 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2202  Pyrrolo-quinoline quinone  22.86 
 
 
363 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1740  Pyrrolo-quinoline quinone  21.94 
 
 
451 aa  48.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0597  pyrrolo-quinoline quinone  20.23 
 
 
380 aa  48.1  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.601567 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2426  Pyrrolo-quinoline quinone  21.91 
 
 
440 aa  47.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.915417 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>