91 Unclonable genes were found for selected organism/s



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
GSU0016  CDS  NC_002939  24354  25295  -  942  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase domain-containing protein  NP_951078  unclonable  0.000161985  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0024  CDS  NC_002939  34573  35157  -  585  OmpA domain-containing protein  NP_951086  unclonable  0.0000404844  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0207  CDS  NC_002939  217397  217597  +  201  cold-shock domain-contain protein  NP_951268  unclonable  0.0000092661  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0274  CDS  NC_002939  282877  284736  +  1860  cytochrome c family protein  NP_951335  unclonable  0.00552346  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0284  CDS  NC_002939  313467  313823  -  357  dnaK suppressor protein  NP_951344  unclonable  0.0000202655  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0290  CDS  NC_002939  319532  320512  +  981  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) synthase III  NP_951350  unclonable  0.000281489  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0331  CDS  NC_002939  361506  362900  +  1395  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  NP_951391  unclonable  0.00109847  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0332  CDS  NC_002939  362976  364466  +  1491  leucyl aminopeptidase  NP_951392  unclonable  0.00199325  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0338  CDS  NC_002939  367863  368219  +  357  NADH dehydrogenase I, A subunit  NP_951398  unclonable  0.0000109925  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0360  CDS  NC_002939  391444  392733  +  1290  OmpA domain-containing protein  NP_951419  unclonable  0.00108723  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0465  CDS  NC_002939  495363  495926  +  564  elongation factor P  NP_951524  unclonable  0.000040903  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0489  CDS  NC_002939  519735  521264  +  1530  Mg chelatase-related protein  NP_951548  unclonable  0.00382275  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0490  CDS  NC_002939  521516  523111  +  1596  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  NP_951549  unclonable  0.00382275  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0514  CDS  NC_002939  548065  548847  -  783  IclR family transcriptional regulator  NP_951572  unclonable  0.000101936  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0534  CDS  NC_002939  566814  567278  +  465  Rrf2 family protein  NP_951592  unclonable  0.0000152989  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0592  CDS  NC_002939  624366  625355  -  990  cytochrome c family protein  NP_951650  unclonable  0.000257113  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0610  CDS  NC_002939  646167  647438  +  1272  phosphoribosylamine--glycine ligase  NP_951668  unclonable  0.00101284  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0618  CDS  NC_002939  654657  655355  +  699  cytochrome c family protein  NP_951676  unclonable  0.0000761444  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0619  CDS  NC_002939  655534  657777  +  2244  hypothetical protein  NP_951677  unclonable  0.00670528  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0669  CDS  NC_002939  703638  703754  -  117  hypothetical protein  NP_951726  unclonable  0.00000333846  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0670  CDS  NC_002939  703800  704654  -  855  cytochrome c family protein  NP_951727  unclonable  0.000144987  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0732  CDS  NC_002939  778861  779289  -  429  nucleoside diphosphate kinase regulator protein, putative  NP_951789  unclonable  0.0000152989  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0856  CDS  NC_002939  915644  916507  -  864  M48 family peptidase  NP_951913  unclonable  0.000166966  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0857  CDS  NC_002939  916867  917445  +  579  hypothetical protein  NP_951914  unclonable  0.0000443477  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0897  CDS  NC_002939  962153  963028  +  876  hypothetical protein  NP_951953  unclonable  0.000129772  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU0921  CDS  NC_002939  986118  988544  -  2427  ribonuclease, Rne/Rng family protein  NP_951975  unclonable  0.00650126  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1070  CDS  NC_002939  1158814  1160568  -  1755  sodium/solute symporter family protein  NP_952123  unclonable  0.00394385  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1091  CDS  NC_002939  1176531  1177496  +  966  putative lipoprotein  NP_952144  unclonable  0.000494647  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1108  CDS  NC_002939  1194322  1195749  +  1428  aldehyde dehydrogenase family protein  NP_952161  unclonable  0.00189493  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1109  CDS  NC_002939  1195698  1196171  -  474  hypothetical protein  NP_952162  unclonable  0.0000228689  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1110  CDS  NC_002939  1196273  1196686  +  414  nucleoside diphosphate kinase  NP_952163  unclonable  0.0000208887  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1111  CDS  NC_002939  1196753  1197835  +  1083  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  NP_952164  unclonable  0.000337587  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1158  CDS  NC_002939  1263496  1264074  +  579  superoxide dismutase  NP_952211  unclonable  0.0000413259  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1190  CDS  NC_002939  1295588  1296622  -  1035  tRNA 2-selenouridine synthase  NP_952243  unclonable  0.000287258  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1200  CDS  NC_002939  1303580  1304788  +  1209  30S ribosomal protein S1  NP_952253  unclonable  0.000802868  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1213  CDS  NC_002939  1315449  1316765  -  1317  hypothetical protein  NP_952266  unclonable  0.00120298  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1215  CDS  NC_002939  1318089  1319810  +  1722  transport ATP-binding protein CydD  NP_952268  unclonable  0.00367068  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1266  CDS  NC_002939  1377368  1379170  +  1803  GTP-binding protein LepA  NP_952319  unclonable  0.00508967  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1296  CDS  NC_002939  1414746  1416926  +  2181  sensory box histidine kinase/response regulator  NP_952349  unclonable  0.00691779  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1414  CDS  NC_002939  1551250  1553784  +  2535  sensory box histidine kinase/response regulator  NP_952466  unclonable  0.00865388  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1463  CDS  NC_002939  1603748  1605532  +  1785  aspartyl-tRNA synthetase  NP_952514  unclonable  0.0040271  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1465  CDS  NC_002939  1606538  1608760  +  2223  isocitrate dehydrogenase, NADP-dependent  NP_952516  unclonable  0.00781151  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1515  CDS  NC_002939  1662153  1664063  +  1911  threonyl-tRNA synthetase  NP_952566  unclonable  0.00436769  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1561  CDS  NC_002939  1714573  1716561  +  1989  1A family penicillin-binding protein  NP_952612  unclonable  0.00865388  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1592  CDS  NC_002939  1745512  1745778  +  267  30S ribosomal protein S15  NP_952643  unclonable  0.00000646106  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1626  CDS  NC_002939  1780852  1781577  +  726  GntR family transcriptional regulator  NP_952677  unclonable  0.0000858772  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1628  CDS  NC_002939  1782373  1784337  -  1965  bifunctional phosphoglycerate kinase/triosephosphate isomerase  NP_952679  unclonable  0.00657054  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1629  CDS  NC_002939  1784444  1785445  -  1002  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase 1  NP_952680  unclonable  0.000305285  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1630  CDS  NC_002939  1785617  1787749  +  2133  sensory box histidine kinase  NP_952681  unclonable  0.00580838  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1739  CDS  NC_002939  1903693  1905450  -  1758  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  NP_952789  unclonable  0.00355798  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1752  CDS  NC_002939  1915425  1915988  +  564  elongation factor P  NP_952802  unclonable  0.0000421728  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1766  CDS  NC_002939  1928901  1929131  -  231  exodeoxyribonuclease VII small subunit  NP_952816  unclonable  0.00000846618  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1767  CDS  NC_002939  1929198  1930541  -  1344  exodeoxyribonuclease VII large subunit  NP_952817  unclonable  0.00135793  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1771  CDS  NC_002939  1934867  1935514  -  648  hypothetical protein  NP_952821  unclonable  0.0000858772  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1798  CDS  NC_002939  1963664  1965250  -  1587  putative alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase family transferase  NP_952848  unclonable  0.0044129  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1799  CDS  NC_002939  1965367  1966584  -  1218  aspartate kinase  NP_952849  unclonable  0.00100247  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1857  CDS  NC_002939  2032030  2032995  -  966  hypothetical protein  NP_952906  unclonable  0.000442866  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1863  CDS  NC_002939  2039953  2040456  +  504  Ros/MucR family transcriptional regulator  NP_952912  unclonable  0.0000224097  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1878  CDS  NC_002939  2056980  2057969  +  990  sensor histidine kinase  NP_952927  unclonable  0.000152464  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1880  CDS  NC_002939  2058779  2059942  -  1164  S-adenosylmethionine synthetase  NP_952929  unclonable  0.000337587  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1905  CDS  NC_002939  2083466  2083666  +  201  cold shock domain-contain protein  NP_952954  unclonable  0.00000974395  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1995  CDS  NC_002939  2187104  2187832  -  729  hypothetical protein  NP_953044  unclonable  0.000089433  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1998  CDS  NC_002939  2190339  2191451  -  1113  transporter, putative  NP_953047  unclonable  0.000649848  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU1999  CDS  NC_002939  2191488  2191712  -  225  hfq protein  NP_953048  unclonable  0.0000129035  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU2012  CDS  NC_002939  2204955  2205812  -  858  NifU family protein  NP_953061  unclonable  0.000109359  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU2048  CDS  NC_002939  2247599  2248000  -  402  hypothetical protein  NP_953097  unclonable  0.0000179688  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU2049  CDS  NC_002939  2248053  2249234  -  1182  bifunctional ornithine acetyltransferase/N-acetylglutamate synthase protein  NP_953098  unclonable  0.000663169  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU2297  CDS  NC_002939  2514738  2517026  -  2289  sensory box histidine kinase  NP_953346  unclonable  0.00806153  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU2299  CDS  NC_002939  2518345  2519793  +  1449  cytochrome c family protein  NP_953348  unclonable  0.00176579  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU2347  CDS  NC_002939  2566187  2567188  +  1002  hypothetical protein  NP_953394  unclonable  0.000241931  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU2350  CDS  NC_002939  2567662  2569557  +  1896  potassium uptake protein, Kup system  NP_953397  unclonable  0.00598886  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU2377  CDS  NC_002939  2604759  2606333  -  1575  hypothetical protein  NP_953423  unclonable  0.00270409  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU2441  CDS  NC_002939  2674961  2675707  -  747  hypothetical protein  NP_953487  unclonable  0.0000635831  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU2442  CDS  NC_002939  2675932  2676954  -  1023  RelA/SpoT domain-containing protein  NP_953488  unclonable  0.000241931  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU2603  CDS  NC_002939  2870277  2872001  -  1725  30S ribosomal protein S1  NP_953648  unclonable  0.00445858  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU2761  CDS  NC_002939  3041518  3043071  -  1554  FAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit  NP_953805  unclonable  0.00308859  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU2780  CDS  NC_002939  3058694  3059200  -  507  hypothetical protein  NP_953824  unclonable  0.0000282289  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU2781  CDS  NC_002939  3059292  3060410  +  1119  RND family efflux transporter MFP subunit  NP_953825  unclonable  0.00032103  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU2876  CDS  NC_002939  3152018  3152449  -  432  50S ribosomal protein L13  NP_953918  unclonable  0.0000282289  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU2888  CDS  NC_002939  3173653  3175164  -  1512  B12 binding /radical SAM domain-containing protein  NP_953930  unclonable  0.00308859  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU3207  CDS  NC_002939  3513216  3514757  -  1542  phosphoglyceromutase  NP_954248  unclonable  0.00207704  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU3211  CDS  NC_002939  3516342  3517598  -  1257  gamma-glutamyl phosphate reductase  NP_954252  unclonable  0.000676761  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU3236  CDS  NC_002939  3550937  3551245  -  309  50S ribosomal protein L21  NP_954277  unclonable  0.0000156169  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU3259  CDS  NC_002939  3573587  3575110  -  1524  cytochrome c family protein  NP_954300  unclonable  0.00302296  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU3291  CDS  NC_002939  3609341  3611383  -  2043  membrane-bound proton-translocating pyrophosphatase  NP_954331  unclonable  0.00806153  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU3292  CDS  NC_002939  3611697  3612062  +  366  FUR family transcriptional regulator  NP_954332  unclonable  0.0000231053  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU3302  CDS  NC_002939  3624910  3626568  +  1659  methylmalonyl-CoA mutase, putative  NP_954342  unclonable  0.00398466  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU3305  CDS  NC_002939  3628992  3629273  +  282  hypothetical protein  NP_954345  unclonable  0.00000974395  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU3306  CDS  NC_002939  3629453  3630970  +  1518  hypothetical protein  NP_954346  unclonable  0.00244316  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU3308  CDS  NC_002939  3632453  3633754  +  1302  adenylosuccinate synthetase  NP_954348  unclonable  0.00120298  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
GSU3311  CDS  NC_002939  3635189  3636091  +  903  hypothetical protein  NP_954351  unclonable  0.000199952  n/a    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>