More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0332 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0332  leucyl aminopeptidase  100 
 
 
496 aa  994    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00199325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3361  leucyl aminopeptidase  65.23 
 
 
496 aa  669    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000650646  hitchhiker  0.00562163 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4252  leucyl aminopeptidase  62.21 
 
 
495 aa  614  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2725  leucyl aminopeptidase  55.44 
 
 
492 aa  530  1e-149  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00941459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1516  leucyl aminopeptidase  54.47 
 
 
491 aa  526  1e-148  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0890319 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0200  aminopeptidase A/I  50 
 
 
497 aa  442  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000277663  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1016  leucyl aminopeptidase  50.11 
 
 
482 aa  430  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0295  leucyl aminopeptidase  47.18 
 
 
488 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0699  leucyl aminopeptidase  47.5 
 
 
487 aa  400  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0267193  normal  0.882342 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11650  leucyl aminopeptidase  44.65 
 
 
496 aa  391  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2099  aminopeptidase A/I  46.17 
 
 
497 aa  388  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41187  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1271  cytosol aminopeptidase  45.37 
 
 
496 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3527  leucyl aminopeptidase  47.27 
 
 
512 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00117428  normal  0.357164 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1091  leucyl aminopeptidase  46.47 
 
 
496 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0289  leucyl aminopeptidase  43.45 
 
 
501 aa  385  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.823293  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0986  leucyl aminopeptidase  46.87 
 
 
497 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.481713  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0989  leucyl aminopeptidase  44.28 
 
 
496 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1018  leucyl aminopeptidase  46.87 
 
 
497 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0978  Leucyl aminopeptidase  43.76 
 
 
506 aa  380  1e-104  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1282  leucyl aminopeptidase  46.47 
 
 
495 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1857  Leucyl aminopeptidase  45.62 
 
 
500 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0980  leucyl aminopeptidase  46.44 
 
 
497 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3082  leucyl aminopeptidase  45.12 
 
 
498 aa  376  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0737217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0628  leucyl aminopeptidase  44.33 
 
 
496 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.052928  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1124  leucyl aminopeptidase  48.32 
 
 
485 aa  375  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.67356  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2201  cytosol aminopeptidase  45.62 
 
 
500 aa  376  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152379  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14470  leucyl aminopeptidase  46.47 
 
 
495 aa  377  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2787  leucyl aminopeptidase  45.55 
 
 
499 aa  370  1e-101  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.151843  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4237  leucyl aminopeptidase  45.14 
 
 
497 aa  369  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0746  leucyl aminopeptidase  45.06 
 
 
518 aa  367  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.483343  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0222  leucyl aminopeptidase  43.27 
 
 
496 aa  368  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0191998  normal  0.929203 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2140  Leucyl aminopeptidase  41.45 
 
 
496 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.727293  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2102  leucyl aminopeptidase  40.35 
 
 
512 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0558  PepA aminopeptidase  43.78 
 
 
497 aa  363  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.548083  hitchhiker  0.0000733214 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2676  leucyl aminopeptidase  47.67 
 
 
511 aa  360  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00321125  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0395  leucyl aminopeptidase  41.34 
 
 
504 aa  358  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0961  leucyl aminopeptidase  43.6 
 
 
500 aa  357  2.9999999999999997e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3051  Leucyl aminopeptidase  46.03 
 
 
487 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00163591  normal  0.235432 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0740  leucyl aminopeptidase  40.32 
 
 
501 aa  355  2e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0823  leucyl aminopeptidase  43.94 
 
 
503 aa  352  8e-96  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1022  leucyl aminopeptidase  44.59 
 
 
503 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1015  leucyl aminopeptidase  44.59 
 
 
503 aa  351  1e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.490931  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0939  leucyl aminopeptidase  38.63 
 
 
502 aa  351  2e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.245826  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002428  cytosol aminopeptidase PepA  40.44 
 
 
502 aa  351  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00175472  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1176  leucyl aminopeptidase  44.37 
 
 
503 aa  351  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.624268  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0672  leucyl aminopeptidase  44.59 
 
 
503 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131904  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1653  leucyl aminopeptidase  44.59 
 
 
503 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.197906  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2947  leucyl aminopeptidase  44.59 
 
 
503 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.76246  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2339  leucyl aminopeptidase  44.59 
 
 
503 aa  350  3e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03635  leucyl aminopeptidase  39.84 
 
 
502 aa  349  5e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1076  leucyl aminopeptidase  39.03 
 
 
502 aa  347  2e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0190451  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0910  leucyl aminopeptidase  38.63 
 
 
502 aa  347  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000452493  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0296  leucyl aminopeptidase  38.73 
 
 
488 aa  347  3e-94  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00770459 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0580  leucyl aminopeptidase  41.88 
 
 
503 aa  347  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.458799  normal  0.873186 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1462  leucyl aminopeptidase  42.38 
 
 
498 aa  345  8.999999999999999e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.428409  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2083  leucyl aminopeptidase  40.24 
 
 
503 aa  345  1e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000600102  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0871  leucyl aminopeptidase  38.76 
 
 
502 aa  344  2e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0238632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4007  leucyl aminopeptidase  42.92 
 
 
486 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.502988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1178  leucyl aminopeptidase  38.03 
 
 
502 aa  343  2.9999999999999997e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0526  leucyl aminopeptidase  38.83 
 
 
502 aa  343  2.9999999999999997e-93  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0735759  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2827  leucyl aminopeptidase  37.83 
 
 
502 aa  343  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.246514  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04126  leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 
503 aa  343  5e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0158539  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3737  Leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 
503 aa  343  5e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662158  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1257  leucyl aminopeptidase  38.03 
 
 
502 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0396745  hitchhiker  0.0000114036 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3109  leucyl aminopeptidase  38.03 
 
 
502 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000897805  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4516  leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 
503 aa  343  5e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000167051  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3752  leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 
503 aa  343  5e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00102834  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4740  leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 
503 aa  343  5e-93  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000218455  normal  0.712457 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4832  leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 
503 aa  343  5e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000259407  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3262  leucyl aminopeptidase  38.03 
 
 
502 aa  343  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0507418  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04090  hypothetical protein  40.56 
 
 
503 aa  343  5e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0200795  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5781  leucyl aminopeptidase  40.56 
 
 
503 aa  343  5e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0325394  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3006  leucyl aminopeptidase  37.63 
 
 
502 aa  343  5e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.132109  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2909  leucyl aminopeptidase  37.63 
 
 
502 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.112327  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0795  leucyl aminopeptidase  37.63 
 
 
502 aa  342  7e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3119  leucyl aminopeptidase  38.03 
 
 
502 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000969621  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4821  leucyl aminopeptidase  40.76 
 
 
503 aa  342  7e-93  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000301619  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1214  leucyl aminopeptidase  44.93 
 
 
496 aa  342  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0455494  decreased coverage  0.00000170751 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0098  leucyl aminopeptidase  42.59 
 
 
491 aa  342  1e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1070  leucyl aminopeptidase  45.12 
 
 
496 aa  342  1e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.32941  decreased coverage  0.00000385423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1014  leucyl aminopeptidase  38.43 
 
 
502 aa  342  1e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0465604  normal  0.808003 
 
 
-
 
NC_004310  BR0689  leucyl aminopeptidase  44.06 
 
 
497 aa  341  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.167828  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2115  Leucyl aminopeptidase  44.09 
 
 
492 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.299036 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0680  leucyl aminopeptidase  44.06 
 
 
497 aa  341  2e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0924  leucyl aminopeptidase  37.83 
 
 
502 aa  340  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317075  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0114  leucyl aminopeptidase  42.38 
 
 
491 aa  340  2.9999999999999998e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2225  leucyl aminopeptidase  40.79 
 
 
503 aa  340  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3648  leucyl aminopeptidase  40.76 
 
 
503 aa  340  4e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.433879  normal  0.196646 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1748  leucyl aminopeptidase  40.17 
 
 
493 aa  339  5.9999999999999996e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3679  leucyl aminopeptidase  39.36 
 
 
503 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0257256  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1368  leucyl aminopeptidase  37.02 
 
 
502 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0913  leucyl aminopeptidase  40.79 
 
 
497 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00605227  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4863  leucyl aminopeptidase  40.36 
 
 
503 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0321011  normal  0.585074 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01576  leucyl aminopeptidase  38.46 
 
 
513 aa  338  9.999999999999999e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.327034  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4047  leucyl aminopeptidase  39.36 
 
 
503 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00149505  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4763  leucyl aminopeptidase  40.36 
 
 
503 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000189037  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3543  leucyl aminopeptidase  39.36 
 
 
503 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00770626  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4733  leucyl aminopeptidase  40.36 
 
 
503 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.138793  normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4882  leucyl aminopeptidase  40.36 
 
 
503 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.417344  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4826  leucyl aminopeptidase  40.36 
 
 
503 aa  338  9.999999999999999e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.956713  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>