25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3305 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  181  3e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  87.1 
 
 		 93 aa  161  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  73.12 
 
 		 95 aa  140  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  68.89 
 
 		 92 aa  128  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  77.89 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1311  hypothetical protein  58.62 
 
 		 92 aa  92.4  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  49.43 
 
 		 91 aa  89.4  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3578  hypothetical protein  51.61 
 
 		 91 aa  87.4  6e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.717757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  54.95 
 
 		 90 aa  87  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  44.57 
 
 		 91 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  45.05 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  45.05 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  44.44 
 
 		 168 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3452  hypothetical protein  38 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1983  hypothetical protein  38.27 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.147586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2075  hypothetical protein  53.85 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.84031e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  34 
 
 		 101 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3653  hypothetical protein  39.29 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3111  hypothetical protein  45.76 
 
 		 95 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.993624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  46.27 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0834  hypothetical protein  35.87 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1844  hypothetical protein  49.06 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000454242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2375  hypothetical protein  47.17 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00419116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0272  hypothetical protein  31.88 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>