25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0657 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  183  8e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  77.89 
 
 
93 aa  141  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  72.63 
 
 
93 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  68.42 
 
 
95 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  69.32 
 
 
92 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  52.87 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  50.57 
 
 
91 aa  94  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1311  hypothetical protein  56.32 
 
 
92 aa  87  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  47.19 
 
 
91 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  45.24 
 
 
91 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  52.87 
 
 
90 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3578  hypothetical protein  51.72 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.717757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  44.05 
 
 
91 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3452  hypothetical protein  39.18 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  35.05 
 
 
101 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3653  hypothetical protein  41.38 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  41.49 
 
 
168 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1983  hypothetical protein  40.26 
 
 
100 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.147586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  47.62 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3111  hypothetical protein  45.76 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.993624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2075  hypothetical protein  50 
 
 
88 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.84031e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0834  hypothetical protein  38.2 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1844  hypothetical protein  43.48 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000454242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0272  hypothetical protein  36.59 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2375  hypothetical protein  42.39 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00419116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>