22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3578 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3578  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  177  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.717757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  51.61 
 
 
93 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  50.55 
 
 
93 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  51.72 
 
 
95 aa  83.6  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  43.96 
 
 
91 aa  82  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  43.96 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  48.28 
 
 
92 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  42.53 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  41.38 
 
 
91 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1311  hypothetical protein  49.45 
 
 
92 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  57.81 
 
 
95 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  41.76 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  40.66 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3653  hypothetical protein  44.44 
 
 
108 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2075  hypothetical protein  46.15 
 
 
88 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.84031e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  31.46 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  41.67 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  34.33 
 
 
168 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3452  hypothetical protein  31.76 
 
 
101 aa  48.1  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3111  hypothetical protein  39.66 
 
 
95 aa  47.8  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.993624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1844  hypothetical protein  47.17 
 
 
97 aa  42.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000454242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0834  hypothetical protein  38.89 
 
 
88 aa  40.8  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>