25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0109 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  184  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  68.89 
 
 		 93 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  67.78 
 
 		 93 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  61.8 
 
 		 95 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  69.32 
 
 		 95 aa  102  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  55.43 
 
 		 90 aa  92.8  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  43.48 
 
 		 91 aa  84.3  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  43.68 
 
 		 91 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  44.71 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  42.53 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  41.3 
 
 		 91 aa  79.3  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3578  hypothetical protein  48.28 
 
 		 91 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.717757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1311  hypothetical protein  51.72 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3452  hypothetical protein  36.67 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  36.26 
 
 		 101 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1983  hypothetical protein  39.51 
 
 		 100 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.147586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  36.84 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  52.63 
 
 		 91 aa  61.6  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3653  hypothetical protein  38.2 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3111  hypothetical protein  50.85 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.993624  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0272  hypothetical protein  36.84 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2075  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.84031e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0834  hypothetical protein  38.2 
 
 		 88 aa  51.2  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1844  hypothetical protein  50 
 
 		 97 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000454242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2375  hypothetical protein  44.44 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00419116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>