20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3653 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008607  Ppro_3653  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  222  1e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2075  hypothetical protein  55.29 
 
 
88 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.84031e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  46.34 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  39.29 
 
 
93 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  38.2 
 
 
92 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  36.46 
 
 
168 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3578  hypothetical protein  44.44 
 
 
91 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.717757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  41.98 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  52 
 
 
95 aa  57  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  35.63 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  33.72 
 
 
91 aa  53.5  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  50.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0834  hypothetical protein  39.74 
 
 
88 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  28.92 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  33.72 
 
 
91 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  28.92 
 
 
91 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  38.67 
 
 
90 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3452  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  46.67 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3065  hypothetical protein  42.31 
 
 
104 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>