22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0834 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0834  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  175  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  41.86 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  51.65 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  41.86 
 
 		 91 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  39.56 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  38.46 
 
 		 91 aa  57.4  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  39.13 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  35.87 
 
 		 93 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  36.96 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  38.2 
 
 		 92 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1983  hypothetical protein  42.05 
 
 		 100 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.147586  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3653  hypothetical protein  39.74 
 
 		 108 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3065  hypothetical protein  48.33 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  34.44 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  54 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  48 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  38.54 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0272  hypothetical protein  40.23 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3452  hypothetical protein  37.5 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3111  hypothetical protein  43.94 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.993624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3578  hypothetical protein  38.89 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.717757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  38.71 
 
 		 90 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>