14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3065 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3065  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  214  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  48.44 
 
 		 91 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0834  hypothetical protein  48.33 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1983  hypothetical protein  46.67 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.147586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  41.38 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  32.89 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  39.58 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1844  hypothetical protein  34.33 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000454242 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  37.8 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3653  hypothetical protein  42.31 
 
 		 108 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3111  hypothetical protein  40.98 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.993624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  38.46 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  33.77 
 
 		 91 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  28.75 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>