25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3255 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  87.1 
 
 
93 aa  161  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  72.04 
 
 
95 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  67.78 
 
 
92 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  72.63 
 
 
95 aa  115  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  52.38 
 
 
91 aa  90.5  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1311  hypothetical protein  57.47 
 
 
92 aa  88.2  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  52.75 
 
 
90 aa  87  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  48.81 
 
 
91 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  46.15 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3578  hypothetical protein  50.55 
 
 
91 aa  85.1  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.717757  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  45.05 
 
 
91 aa  84  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  46.15 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3452  hypothetical protein  39.58 
 
 
101 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506452 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1983  hypothetical protein  38.75 
 
 
100 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.147586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  35.42 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  34.74 
 
 
168 aa  62  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2075  hypothetical protein  51.92 
 
 
88 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.84031e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  44.78 
 
 
91 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3111  hypothetical protein  45.76 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.993624  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3653  hypothetical protein  35.63 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0834  hypothetical protein  36.96 
 
 
88 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1844  hypothetical protein  40.45 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000454242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0272  hypothetical protein  33.33 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2375  hypothetical protein  39.33 
 
 
97 aa  47  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00419116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>