25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0569 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  187  5.999999999999999e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  85.71 
 
 		 91 aa  164  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  60.67 
 
 		 91 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  57.3 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  52.38 
 
 		 93 aa  90.5  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  49.43 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  49.43 
 
 		 93 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  52.33 
 
 		 91 aa  88.2  3e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  43.68 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  52.87 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  44.94 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1311  hypothetical protein  52.17 
 
 		 92 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3578  hypothetical protein  42.53 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.717757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0834  hypothetical protein  41.86 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3452  hypothetical protein  41.3 
 
 		 101 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  39.13 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  49.18 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3111  hypothetical protein  42.65 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.993624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1983  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.147586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1844  hypothetical protein  35.79 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000454242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  41.07 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3653  hypothetical protein  28.92 
 
 		 108 aa  47.4  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2075  hypothetical protein  40.38 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.84031e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0272  hypothetical protein  35.06 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2375  hypothetical protein  33.68 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00419116  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>