24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1311 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1311  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  58.62 
 
 
93 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  59.77 
 
 
95 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  57.47 
 
 
93 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  52.17 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  49.43 
 
 
91 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  51.72 
 
 
92 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3578  hypothetical protein  49.45 
 
 
91 aa  90.1  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.717757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  54.02 
 
 
95 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  49.43 
 
 
91 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  54.02 
 
 
91 aa  83.6  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  47.25 
 
 
91 aa  77.8  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3452  hypothetical protein  36.56 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  45.35 
 
 
90 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  35.96 
 
 
101 aa  61.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3111  hypothetical protein  41.67 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.993624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  37.78 
 
 
168 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  53.57 
 
 
91 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3653  hypothetical protein  36.05 
 
 
108 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2075  hypothetical protein  48 
 
 
88 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.84031e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1983  hypothetical protein  33.73 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.147586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0272  hypothetical protein  32.67 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0834  hypothetical protein  38.75 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1844  hypothetical protein  44.44 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000454242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>