21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1844 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1844  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  197  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000454242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2375  hypothetical protein  93.81 
 
 		 97 aa  166  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00419116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  44.21 
 
 		 168 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  42.27 
 
 		 95 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3452  hypothetical protein  37.89 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  36.84 
 
 		 101 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  41.76 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  41.76 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  47.69 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  37.89 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  41.76 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  36.84 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  47.46 
 
 		 91 aa  50.8  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  43.48 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  35.11 
 
 		 91 aa  49.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  34.38 
 
 		 91 aa  47  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3578  hypothetical protein  36.26 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.717757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  35.87 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3065  hypothetical protein  29.41 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2075  hypothetical protein  41.82 
 
 		 88 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.84031e-16 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3653  hypothetical protein  34.07 
 
 		 108 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>