25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2186 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  100 
 
 
91 aa  181  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  52.33 
 
 
91 aa  92.4  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  52.33 
 
 
91 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  45.05 
 
 
93 aa  84.3  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  45.26 
 
 
95 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  46.15 
 
 
93 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  41.3 
 
 
92 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  45.35 
 
 
91 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  44.19 
 
 
91 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  43.82 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3578  hypothetical protein  41.76 
 
 
91 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.717757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1311  hypothetical protein  54.02 
 
 
92 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  43.02 
 
 
90 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0834  hypothetical protein  39.56 
 
 
88 aa  60.5  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3452  hypothetical protein  50 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506452 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3653  hypothetical protein  41.98 
 
 
108 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  38.04 
 
 
101 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  51.72 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  44.64 
 
 
168 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3111  hypothetical protein  42.37 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.993624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1983  hypothetical protein  32.18 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.147586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2075  hypothetical protein  48.08 
 
 
88 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.84031e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0272  hypothetical protein  32.58 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3065  hypothetical protein  37.8 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1844  hypothetical protein  42.86 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000454242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>