23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3452 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3452  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  203  5e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506452 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  91.09 
 
 
101 aa  185  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  37.63 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  45.31 
 
 
90 aa  67  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  38 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  36.46 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  39.58 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  36.67 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  44.09 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  41.3 
 
 
91 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  45.16 
 
 
95 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  51.92 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  42.22 
 
 
91 aa  58.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  40.32 
 
 
91 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1983  hypothetical protein  41.33 
 
 
100 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.147586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1844  hypothetical protein  35.11 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000454242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3111  hypothetical protein  44.07 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.993624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2375  hypothetical protein  32.98 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00419116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1311  hypothetical protein  36.76 
 
 
92 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3578  hypothetical protein  31.76 
 
 
91 aa  48.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.717757  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3653  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0834  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>