24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0810 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  100 
 
 
101 aa  205  1e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3452  hypothetical protein  91.09 
 
 
101 aa  185  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  38.71 
 
 
168 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  43.94 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  36.26 
 
 
92 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  43.01 
 
 
91 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  35.42 
 
 
95 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  34 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  35.42 
 
 
93 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  39.13 
 
 
91 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  43.33 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  42.31 
 
 
91 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  38.04 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  41.11 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  40.32 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1844  hypothetical protein  34.04 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000454242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1983  hypothetical protein  38.37 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.147586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3111  hypothetical protein  42.62 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.993624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3578  hypothetical protein  31.46 
 
 
91 aa  51.6  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.717757  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3653  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  50.8  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2375  hypothetical protein  31.91 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00419116  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1311  hypothetical protein  35.96 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0834  hypothetical protein  38.54 
 
 
88 aa  44.7  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0272  hypothetical protein  32.93 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>