22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2075 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2075  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  176  7e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.84031e-16 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3653  hypothetical protein  55.29 
 
 		 108 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  46.67 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  44.94 
 
 		 93 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  44.94 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  43.96 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  36.56 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  32.95 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  37.21 
 
 		 91 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3578  hypothetical protein  35.71 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.717757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  37.5 
 
 		 91 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  39.56 
 
 		 90 aa  54.3  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  35.23 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  32.95 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3452  hypothetical protein  34.48 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1844  hypothetical protein  37.11 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000454242 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1311  hypothetical protein  38.37 
 
 		 92 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2375  hypothetical protein  36.08 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00419116  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3111  hypothetical protein  41.67 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.993624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0834  hypothetical protein  35.71 
 
 		 88 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>