23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3111 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3111  hypothetical protein  100 
 
 		 95 aa  193  7e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.993624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1983  hypothetical protein  52.44 
 
 		 100 aa  83.6  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.147586  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  49.35 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0272  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  44.58 
 
 		 91 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  46.07 
 
 		 92 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  54.55 
 
 		 91 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  36.47 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  38.55 
 
 		 91 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  37.5 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  36.47 
 
 		 93 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  42.65 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  46.55 
 
 		 90 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  45.76 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  35.48 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  37.35 
 
 		 91 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3452  hypothetical protein  40.24 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  39.13 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1311  hypothetical protein  37.08 
 
 		 92 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3578  hypothetical protein  33.71 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.717757  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2075  hypothetical protein  41.67 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.84031e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0834  hypothetical protein  44.62 
 
 		 88 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3065  hypothetical protein  40.98 
 
 		 104 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>