19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2375 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2375  hypothetical protein  100 
 
 		 97 aa  197  3.9999999999999996e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00419116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1844  hypothetical protein  93.81 
 
 		 97 aa  167  5e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000454242 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  45.26 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  40.21 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3452  hypothetical protein  36.84 
 
 		 101 aa  57  0.00000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506452 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  41.76 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  41.76 
 
 		 93 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  35.79 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  43.08 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  35.79 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  42.39 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  34.74 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  42.37 
 
 		 91 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  34.04 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  37.36 
 
 		 92 aa  45.4  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3653  hypothetical protein  34.07 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  31.25 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  32.61 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0670  peptidase M50  30.11 
 
 		 697 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.726178  normal  0.0130371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>