26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2780 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  100 
 
 		 168 aa  350  7e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1844  hypothetical protein  41.49 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000454242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2375  hypothetical protein  41.49 
 
 		 97 aa  73.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00419116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  38.71 
 
 		 101 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3452  hypothetical protein  37.63 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506452 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  44.44 
 
 		 93 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  40.21 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  43.75 
 
 		 90 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  36.84 
 
 		 92 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  34.74 
 
 		 93 aa  62  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_008607  Ppro_3653  hypothetical protein  36.46 
 
 		 108 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  50.88 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2075  hypothetical protein  49.02 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.84031e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  48.21 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  40.7 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  44.64 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3111  hypothetical protein  42.03 
 
 		 95 aa  51.2  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.993624  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  39.29 
 
 		 91 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0834  hypothetical protein  54 
 
 		 88 aa  48.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  41.07 
 
 		 91 aa  48.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3578  hypothetical protein  34.33 
 
 		 91 aa  47.8  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.717757  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1983  hypothetical protein  37.14 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.147586  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  27.96 
 
 		 91 aa  45.8  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1311  hypothetical protein  37.78 
 
 		 92 aa  44.7  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0272  hypothetical protein  34.07 
 
 		 103 aa  41.6  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3065  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  41.2  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>