25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0568 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  184  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  85.71 
 
 		 91 aa  165  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  60.67 
 
 		 91 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  57.3 
 
 		 91 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  46.15 
 
 		 93 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  43.96 
 
 		 90 aa  84.3  5e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  43.48 
 
 		 92 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  45.05 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3578  hypothetical protein  43.96 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.717757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  45.78 
 
 		 95 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  45.35 
 
 		 91 aa  76.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  54.1 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1311  hypothetical protein  49.43 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3111  hypothetical protein  56.36 
 
 		 95 aa  67  0.00000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.993624  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  39.56 
 
 		 91 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  42.31 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3452  hypothetical protein  51.92 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506452 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2075  hypothetical protein  48.08 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.84031e-16 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  39.29 
 
 		 168 aa  49.7  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3653  hypothetical protein  33.72 
 
 		 108 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0834  hypothetical protein  34.44 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1983  hypothetical protein  33.33 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.147586  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3065  hypothetical protein  32.89 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0272  hypothetical protein  32.05 
 
 		 103 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1844  hypothetical protein  35.48 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000454242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>