18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0272 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0272  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  214  2.9999999999999998e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1983  hypothetical protein  52.86 
 
 		 100 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.147586  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3111  hypothetical protein  50 
 
 		 95 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.993624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0109  hypothetical protein  36.84 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3402  hypothetical protein  37.31 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.329085  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2131  hypothetical protein  36.84 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0657  hypothetical protein  36.99 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000682616  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  3.04139e-18  decreased coverage  7.86059e-21 
 
 
 
NC_011146  Gbem_0555  hypothetical protein  40 
 
 		 91 aa  45.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000049421  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0556  hypothetical protein  36.36 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000586075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0569  hypothetical protein  35.06 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1741e-20 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2186  hypothetical protein  32.58 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000506337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2932  hypothetical protein  44 
 
 		 90 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3305  hypothetical protein  31.88 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000974395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0834  hypothetical protein  40.23 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.358274  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0810  hypothetical protein  32.93 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2780  hypothetical protein  34.07 
 
 		 168 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000282289  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0568  hypothetical protein  32.05 
 
 		 91 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9999899999999995e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>