More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0455 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1817  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  66.38 
 
 		 585 aa  757    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0771206 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00083  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  70.69 
 
 		 558 aa  785    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.491155  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0396  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  98.84 
 
 		 602 aa  1193    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0455  single-stranded DNA exonuclease  100 
 
 		 602 aa  1207    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1488  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.53 
 
 		 569 aa  521  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  50.88 
 
 		 571 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3298  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.39 
 
 		 580 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.746333  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.22 
 
 		 569 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.05 
 
 		 569 aa  513  1e-144  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1082  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.7 
 
 		 569 aa  512  1e-144  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39440  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.93 
 
 		 569 aa  515  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.31407  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.87 
 
 		 569 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.810057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0881  ssDNA exonuclease RecJ  48.6 
 
 		 577 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.796775  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0647  ssDNA exonuclease RecJ  48.09 
 
 		 584 aa  507  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.252802  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  48.6 
 
 		 577 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3849  ssDNA exonuclease RecJ  48.6 
 
 		 577 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.333614 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0863  ssDNA exonuclease RecJ  48.61 
 
 		 584 aa  504  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1819  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.17 
 
 		 577 aa  503  1e-141  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0649366  normal  1 
 
 
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NC_007484  Noc_1189  RecJ exonuclease  48.46 
 
 		 574 aa  499  1e-140  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1035  exonuclease RecJ  48.07 
 
 		 569 aa  501  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1395  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50 
 
 		 571 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3376  exonuclease RecJ  50 
 
 		 569 aa  499  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.593595 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004439  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.84 
 
 		 579 aa  495  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16220  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.47 
 
 		 571 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3890  ssDNA exonuclease RecJ  47.55 
 
 		 577 aa  495  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.874306  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0952  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.18 
 
 		 574 aa  489  1e-137  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.37 
 
 		 576 aa  490  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3226  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.01 
 
 		 574 aa  486  1e-136  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0628  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.83 
 
 		 599 aa  484  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3198  ssDNA exonuclease RecJ  46.23 
 
 		 577 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.697919  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3273  ssDNA exonuclease RecJ  46.23 
 
 		 577 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  44.16 
 
 		 579 aa  484  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3051  ssDNA exonuclease RecJ  45.95 
 
 		 577 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0892  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.83 
 
 		 584 aa  484  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.488933  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3210  ssDNA exonuclease RecJ  46.23 
 
 		 577 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1460  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  50.18 
 
 		 574 aa  484  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3378  ssDNA exonuclease RecJ  46.23 
 
 		 577 aa  483  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0797  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.84 
 
 		 574 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3329  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.01 
 
 		 574 aa  485  1e-135  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3276  ssDNA exonuclease RecJ  46.23 
 
 		 577 aa  484  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02724  ssDNA exonuclease, 5' -> 3'-specific  45.77 
 
 		 577 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0329903  n/a   
 
 
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CP001637  EcDH1_0800  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.44 
 
 		 577 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133644  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1993  ssDNA exonuclease RecJ  45.18 
 
 		 584 aa  482  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1417  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.79 
 
 		 579 aa  479  1e-134  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012892  B21_02687  hypothetical protein  45.77 
 
 		 577 aa  479  1e-134  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0479122  n/a   
 
 
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NC_009801  EcE24377A_3218  ssDNA exonuclease RecJ  45.77 
 
 		 577 aa  480  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0817  ssDNA exonuclease RecJ  45.44 
 
 		 577 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3447  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.14 
 
 		 574 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3522  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.49 
 
 		 577 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1567  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.87 
 
 		 579 aa  477  1e-133  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_0772  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.9 
 
 		 574 aa  478  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.167693  hitchhiker  0.00446395 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4183  ssDNA exonuclease RecJ  45.42 
 
 		 577 aa  477  1e-133  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3025  ssDNA exonuclease RecJ  45.42 
 
 		 577 aa  475  1e-133  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0845  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.49 
 
 		 577 aa  477  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3641  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.32 
 
 		 577 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1474  single-strand DNA-specific exonuclease  44.71 
 
 		 573 aa  476  1e-133  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010658  SbBS512_E3312  ssDNA exonuclease RecJ  45.6 
 
 		 577 aa  478  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0807  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.22 
 
 		 574 aa  475  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_4094  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.19 
 
 		 584 aa  472  1e-132  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1569  single-stranded-DNA-specific exonuclease  44.85 
 
 		 574 aa  473  1e-132  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.160712  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0665  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.13 
 
 		 574 aa  472  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0729862  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0618  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.85 
 
 		 574 aa  473  1e-132  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3310  ssDNA exonuclease RecJ  46.14 
 
 		 577 aa  470  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.24828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03407  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.68 
 
 		 573 aa  471  1.0000000000000001e-131  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  44.78 
 
 		 581 aa  472  1.0000000000000001e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1115  single-stranded-DNA-specific exonuclease protein  48.76 
 
 		 565 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00151931  normal  0.274168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.52 
 
 		 563 aa  466  9.999999999999999e-131  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0749  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.92 
 
 		 574 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0015193  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3760  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.03 
 
 		 610 aa  464  1e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.671236 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3302  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.23 
 
 		 572 aa  465  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0912686  normal  0.117483 
 
 
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NC_008740  Maqu_2272  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.9 
 
 		 577 aa  462  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I0564  ssDNA exonuclease RecJ  44.01 
 
 		 579 aa  463  1e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.755584  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1154  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.59 
 
 		 565 aa  464  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0447096 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  47.7 
 
 		 566 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  47.34 
 
 		 565 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1208  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.71 
 
 		 573 aa  462  9.999999999999999e-129  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0895  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.24 
 
 		 574 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2758  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.87 
 
 		 574 aa  455  1e-127  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2026  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.15 
 
 		 565 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.698536 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1771  exonuclease RecJ  47.7 
 
 		 565 aa  457  1e-127  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.495895  normal  0.722264 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2737  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.85 
 
 		 574 aa  458  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2153  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.32 
 
 		 565 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000147893  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0897  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.56 
 
 		 574 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3712  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.25 
 
 		 572 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1470  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.41 
 
 		 586 aa  449  1e-125  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  45.39 
 
 		 566 aa  452  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5422  RecJ exonuclease  48.06 
 
 		 565 aa  451  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5961  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.06 
 
 		 565 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.987838  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.04 
 
 		 574 aa  448  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3183  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.56 
 
 		 576 aa  444  1e-123  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.620081  normal  1 
 
 
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NC_009074  BURPS668_2588  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.09 
 
 		 564 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010531  Pnec_0487  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.8 
 
 		 601 aa  444  1e-123  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.624528  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_2134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.88 
 
 		 565 aa  443  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
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NC_008542  Bcen2424_2116  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.06 
 
 		 565 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.457344  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_5406  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.5 
 
 		 572 aa  441  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A2205  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.92 
 
 		 564 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_1448  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  47.18 
 
 		 577 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007651  BTH_I1885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  46.09 
 
 		 564 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214774  n/a   
 
 
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NC_007908  Rfer_3234  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.62 
 
 		 576 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.224513  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_1012  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  44.26 
 
 		 600 aa  442  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0694189 
 
 
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