More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3262 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
374 aa  715    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.67 
 
 
341 aa  424  1e-117  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  66.24 
 
 
341 aa  416  9.999999999999999e-116  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108082  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0213  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  57.02 
 
 
389 aa  413  1e-114  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0144  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  62.05 
 
 
317 aa  358  9e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18020  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  68.71 
 
 
343 aa  357  1.9999999999999998e-97  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.318442  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.09 
 
 
292 aa  222  7e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19595  decreased coverage  0.000508122 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.35 
 
 
292 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.35 
 
 
292 aa  220  3e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.771359  normal  0.585701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4060  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  39.8 
 
 
292 aa  211  2e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.64 
 
 
287 aa  204  2e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 
287 aa  203  4e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2052  oligopeptides ABC transporter permease protein  40.81 
 
 
290 aa  201  1.9999999999999998e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.33 
 
 
295 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2263  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.46 
 
 
296 aa  194  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 
291 aa  194  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0926789  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
305 aa  186  7e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
290 aa  186  8e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.287104  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
286 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.79 
 
 
299 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.64 
 
 
299 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
299 aa  177  4e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.553979  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
299 aa  176  5e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111328  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.26 
 
 
262 aa  175  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.452805  hitchhiker  0.000000299864 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
298 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0407535  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  39.93 
 
 
317 aa  173  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.22 
 
 
313 aa  170  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1755  putative ABC transporter, oligopeptides  35.66 
 
 
283 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.581834  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.78 
 
 
301 aa  169  5e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.07 
 
 
304 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.44 
 
 
289 aa  169  8e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109416  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04201  putative ABC transporter of oligopeptides  38.75 
 
 
283 aa  168  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.88 
 
 
310 aa  169  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.37 
 
 
287 aa  168  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.42 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16510  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  38.04 
 
 
321 aa  166  8e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.69344 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20721  putative ABC transporter, oligopeptides  40.43 
 
 
289 aa  166  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.591498 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0718  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  36.42 
 
 
298 aa  166  9e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  34.6 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  34.6 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  37.58 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  36.2 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  34.6 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  34.6 
 
 
299 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  34.6 
 
 
299 aa  164  3e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1579  putative ABC transporter, oligopeptides  40.53 
 
 
273 aa  163  6e-39  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.48 
 
 
296 aa  163  6e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1495  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.57 
 
 
263 aa  162  6e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  37.05 
 
 
867 aa  162  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.66 
 
 
300 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  39.66 
 
 
300 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.38 
 
 
326 aa  161  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230342  normal  0.0495653 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
300 aa  162  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.14 
 
 
303 aa  162  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11217  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.68 
 
 
309 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0800  putative ABC transporter, oligopeptides  39.1 
 
 
290 aa  161  2e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.494222  normal  0.0258262 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.44 
 
 
301 aa  161  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  39.36 
 
 
304 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04771  putative ABC transporter, oligopeptides  37.04 
 
 
252 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  33.55 
 
 
303 aa  160  5e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.04 
 
 
280 aa  159  5e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4051  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.78 
 
 
306 aa  159  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.722195  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.32 
 
 
303 aa  159  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.43 
 
 
305 aa  159  8e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186771  normal  0.317689 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
302 aa  159  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  33.88 
 
 
303 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.82 
 
 
280 aa  159  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  33.88 
 
 
303 aa  159  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  33.88 
 
 
303 aa  159  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.55 
 
 
303 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
303 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  32.92 
 
 
299 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2358  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  40.57 
 
 
325 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0041111  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.55 
 
 
303 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
299 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  33.55 
 
 
303 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.96 
 
 
303 aa  157  2e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.31 
 
 
299 aa  157  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.11 
 
 
262 aa  157  3e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2796  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.79 
 
 
299 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4454  opine ABC transporter, permease protein, putative  37.23 
 
 
290 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000504442 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
310 aa  157  4e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  35.23 
 
 
279 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  38.04 
 
 
288 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0937  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4339  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.05 
 
 
293 aa  156  6e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04721  putative ABC transporter, oligopeptides  38.8 
 
 
251 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.0069399  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04411  putative ABC transporter, oligopeptides  38.8 
 
 
251 aa  155  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.87 
 
 
293 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2946  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  40.42 
 
 
287 aa  155  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  0.633228 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.33 
 
 
300 aa  155  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7518  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  36.21 
 
 
295 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0791708  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2032  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 
285 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.86 
 
 
322 aa  154  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
359 aa  154  2e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.61209  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.87 
 
 
303 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 
300 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.47 
 
 
301 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
301 aa  154  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.70134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
319 aa  154  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.98941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>