More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0144 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0144  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  100 
 
 
317 aa  625  1e-178  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0213  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  64 
 
 
389 aa  408  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.67 
 
 
341 aa  385  1e-106  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  60.25 
 
 
341 aa  379  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108082  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.05 
 
 
374 aa  369  1e-101  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18020  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  57.19 
 
 
343 aa  323  3e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.318442  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 
292 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.99 
 
 
292 aa  232  6e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.771359  normal  0.585701 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2052  oligopeptides ABC transporter permease protein  42.65 
 
 
290 aa  225  6e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.03 
 
 
287 aa  225  9e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.69 
 
 
287 aa  223  4e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.05 
 
 
292 aa  220  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19595  decreased coverage  0.000508122 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4060  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  38.1 
 
 
292 aa  213  1.9999999999999998e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.55 
 
 
291 aa  212  7.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0926789  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.32 
 
 
290 aa  210  2e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.287104  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.31 
 
 
305 aa  201  9.999999999999999e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2263  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.66 
 
 
296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 
295 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.66 
 
 
299 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.73 
 
 
286 aa  198  9e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.45 
 
 
299 aa  186  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.36 
 
 
300 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  40.36 
 
 
300 aa  185  8e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04201  putative ABC transporter of oligopeptides  37.31 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2403  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.1 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000292743  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1755  putative ABC transporter, oligopeptides  37.41 
 
 
283 aa  182  5.0000000000000004e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.581834  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.29 
 
 
301 aa  182  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  39.78 
 
 
300 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3840  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.67 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00781305  normal  0.217965 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.69 
 
 
298 aa  179  4e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0407535  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
299 aa  179  7e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.553979  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  39.22 
 
 
317 aa  179  8e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
299 aa  178  1e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111328  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1183  putative permease of ABC transporter  39.49 
 
 
301 aa  178  1e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.056047  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
287 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.24 
 
 
262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.452805  hitchhiker  0.000000299864 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04771  putative ABC transporter, oligopeptides  37.45 
 
 
252 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  38.1 
 
 
299 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1584  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.42 
 
 
302 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0800  putative ABC transporter, oligopeptides  37.54 
 
 
290 aa  170  2e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.494222  normal  0.0258262 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
312 aa  170  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2972  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
301 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1669  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.32 
 
 
300 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1579  putative ABC transporter, oligopeptides  39.02 
 
 
273 aa  170  3e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0112  dipeptide transporter  38.04 
 
 
304 aa  170  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1493  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
301 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20721  putative ABC transporter, oligopeptides  38.32 
 
 
289 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.591498 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.21 
 
 
310 aa  168  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.21 
 
 
293 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000296229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.9 
 
 
295 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0718  putative dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter, permease protein  37.87 
 
 
298 aa  167  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.724633  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.67 
 
 
289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109416  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0261  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.26 
 
 
276 aa  166  4e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.08 
 
 
311 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.69 
 
 
296 aa  166  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
294 aa  166  5e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
299 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0269  ABC transporter related protein  35.29 
 
 
867 aa  166  6.9999999999999995e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.46 
 
 
310 aa  165  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  36.23 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  36.23 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  36.23 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  36.23 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.49 
 
 
297 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172272  normal  0.144154 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  36.23 
 
 
299 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1658  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.11217  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1765  putative glutathione ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0322  putative ABC transport system permease protein  35.84 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1850  ABC transporter permease  35.84 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.49 
 
 
297 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1356  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.222916  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.95 
 
 
301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0399  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19947  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0241  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  35.84 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.19 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0011  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.7 
 
 
307 aa  163  3e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0417  putative ABC transporter, oligopeptides  37 
 
 
273 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3861  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.25 
 
 
359 aa  163  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.61209  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.87 
 
 
302 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1495  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.67 
 
 
263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  32.97 
 
 
303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1529  dipeptide ABC transporter, permease protein  38.69 
 
 
302 aa  162  6e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.936429  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.15 
 
 
297 aa  162  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1326  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.84 
 
 
303 aa  162  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.999371 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.96 
 
 
300 aa  162  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.08 
 
 
301 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1865  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  36.05 
 
 
297 aa  161  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
310 aa  162  1e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
262 aa  161  1e-38  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.97 
 
 
303 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.11 
 
 
355 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04411  putative ABC transporter, oligopeptides  38.4 
 
 
251 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  32.97 
 
 
303 aa  161  2e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.65 
 
 
305 aa  160  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186771  normal  0.317689 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4201  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
297 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774005  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.69 
 
 
310 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.373123  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.05 
 
 
297 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110641  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1103  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 
277 aa  160  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>