More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_04201 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_04201  putative ABC transporter of oligopeptides  100 
 
 
283 aa  557  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20721  putative ABC transporter, oligopeptides  78.07 
 
 
289 aa  368  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.591498 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1755  putative ABC transporter, oligopeptides  68.84 
 
 
283 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.581834  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04771  putative ABC transporter, oligopeptides  73.71 
 
 
252 aa  359  3e-98  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0800  putative ABC transporter, oligopeptides  73.43 
 
 
290 aa  350  1e-95  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.494222  normal  0.0258262 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1579  putative ABC transporter, oligopeptides  73.86 
 
 
273 aa  341  8e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2052  oligopeptides ABC transporter permease protein  60.44 
 
 
290 aa  303  3.0000000000000004e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1126  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.88 
 
 
292 aa  285  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19595  decreased coverage  0.000508122 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0417  putative ABC transporter, oligopeptides  58.97 
 
 
273 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04721  putative ABC transporter, oligopeptides  65.24 
 
 
251 aa  277  2e-73  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  decreased coverage  0.0069399  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04411  putative ABC transporter, oligopeptides  64.68 
 
 
251 aa  276  4e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1124  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.78 
 
 
292 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1153  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  54.78 
 
 
292 aa  273  3e-72  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.771359  normal  0.585701 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4060  binding-protein-dependent transporter inner membrane protein  54.98 
 
 
292 aa  267  1e-70  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04821  putative ABC transporter, oligopeptides  65.75 
 
 
248 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  55.77 
 
 
295 aa  262  4e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2263  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  54.65 
 
 
296 aa  258  7e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1597  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.82 
 
 
287 aa  229  4e-59  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.69 
 
 
287 aa  226  4e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1190  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.83 
 
 
290 aa  221  9e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.287104  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1783  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.85 
 
 
291 aa  214  1.9999999999999998e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0926789  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0213  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter permease  40.89 
 
 
389 aa  207  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0101333  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.43 
 
 
341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00013185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2722  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.37 
 
 
341 aa  194  2e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.108082  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.83 
 
 
286 aa  185  9e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0144  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  41.09 
 
 
317 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18020  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, permease component  40.66 
 
 
343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.318442  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0603  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.81 
 
 
262 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.452805  hitchhiker  0.000000299864 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5359  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  39.5 
 
 
289 aa  169  7e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.632265  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3262  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.35 
 
 
374 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0421  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.6 
 
 
262 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4105  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
291 aa  166  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0197  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.45 
 
 
275 aa  165  8e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1495  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.52 
 
 
263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6649  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39 
 
 
294 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.789298  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1636  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.19 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.19302  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.31 
 
 
295 aa  162  7e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.74 
 
 
310 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.19 
 
 
469 aa  159  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  36.53 
 
 
299 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  36.53 
 
 
299 aa  157  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  36.53 
 
 
299 aa  157  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2680  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  38.86 
 
 
290 aa  157  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.129024  normal  0.890863 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  36.53 
 
 
299 aa  157  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  36.53 
 
 
299 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.5 
 
 
298 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0407535  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3973  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.05 
 
 
300 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1504  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.74 
 
 
289 aa  155  8e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.109416  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
299 aa  154  1e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.111328  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4111  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.61 
 
 
299 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.553979  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4129  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.27 
 
 
312 aa  154  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1952  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.87 
 
 
302 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.288153  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1410  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
300 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0895579  normal  0.0461956 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  33.58 
 
 
299 aa  152  8.999999999999999e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4054  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
297 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.181968  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.07 
 
 
280 aa  151  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1080  peptide ABC transporter, permease protein  37.69 
 
 
281 aa  150  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0826305  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1924  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.25 
 
 
303 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  36.94 
 
 
282 aa  150  2e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.661918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1663  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.09 
 
 
293 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  normal  0.436885 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
297 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.172272  normal  0.144154 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1671  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.54 
 
 
293 aa  150  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  34.43 
 
 
279 aa  150  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2848  ABC transporter permease protein  37.61 
 
 
276 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.1 
 
 
301 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0838  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  35.17 
 
 
301 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00766751  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0890  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.68 
 
 
303 aa  150  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.221253  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1115  dipeptide ABC transporter, permease protein, putative  35.59 
 
 
300 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1850  ABC transporter permease  35.59 
 
 
302 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0322  putative ABC transport system permease protein  35.59 
 
 
302 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1765  putative glutathione ABC transporter, permease protein  35.59 
 
 
302 aa  149  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4223  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.17 
 
 
301 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.62 
 
 
294 aa  149  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4424  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.75 
 
 
297 aa  149  6e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.434464  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0977  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  35.17 
 
 
302 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.699856  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0241  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  35.17 
 
 
302 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.53 
 
 
311 aa  149  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1356  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  35.17 
 
 
302 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.222916  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0399  putative dipeptide ABC transporter, permease protein  35.17 
 
 
302 aa  149  7e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.19947  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.89 
 
 
309 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0892  glutathione transport system permease protein GsiD  34.68 
 
 
303 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0919  glutathione transport system permease protein GsiD  34.68 
 
 
303 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.285756  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0981  glutathione transport system permease GsiD  34.68 
 
 
303 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1002  glutathione transport system permease GsiD  34.68 
 
 
303 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1321  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.46 
 
 
299 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.213083  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0952  glutathione transport system permease GsiD  34.68 
 
 
303 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.642486  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.68 
 
 
303 aa  148  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1607  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.08 
 
 
355 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2516  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.68 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.245881  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1865  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter inner membrane protein  33.46 
 
 
297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0857  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.68 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0983  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.68 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.631876 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0755  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.04 
 
 
291 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0593743  normal  0.296521 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0903  glutathione ABC transporter, permease protein GsiD  34.68 
 
 
303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00799  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.23 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2810  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.23 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.482593  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1255  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
299 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.356305  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00816  hypothetical protein  34.23 
 
 
303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3650  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.07 
 
 
359 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3351  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.86 
 
 
297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.110641  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>