96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0983 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0289  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  81.1 
 
 
581 aa  932    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0118  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  84.36 
 
 
587 aa  972    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3499  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0983  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  100 
 
 
586 aa  1191    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4780  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  66.23 
 
 
465 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4661  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  66.23 
 
 
465 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3800  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  65.58 
 
 
465 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4651  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  65.8 
 
 
465 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4801  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  65.8 
 
 
465 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4744  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  66.02 
 
 
465 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04060  ascorbate-specific PTS system enzyme IIC  65.37 
 
 
465 aa  609  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04022  hypothetical protein  65.37 
 
 
465 aa  609  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4664  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  65.37 
 
 
465 aa  609  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3820  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  65.37 
 
 
465 aa  609  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4753  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  65.37 
 
 
465 aa  609  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4437  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  65.15 
 
 
465 aa  608  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5709  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  65.37 
 
 
465 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1323  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  44.99 
 
 
485 aa  349  9e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0645  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  39.51 
 
 
488 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.354005  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0142  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  41.96 
 
 
474 aa  335  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010128  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0124  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  38.67 
 
 
471 aa  325  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0921  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  41.06 
 
 
447 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1018  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  41.06 
 
 
447 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.857489  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0956  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  41.06 
 
 
447 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0132  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  37.73 
 
 
443 aa  319  7e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1037  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  40.58 
 
 
447 aa  319  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1016  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  41.3 
 
 
447 aa  318  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.279058 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0988  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  40.82 
 
 
447 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1815  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  40.98 
 
 
479 aa  293  5e-78  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00193674  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0326  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.57 
 
 
503 aa  283  5.000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1996  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  37.16 
 
 
503 aa  266  1e-69  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1546  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  31.04 
 
 
418 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111048  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1437  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  31.04 
 
 
418 aa  182  2e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000156476  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0344  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  31.5 
 
 
418 aa  179  8e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000119572  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20180  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  31.78 
 
 
421 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2055  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  31.3 
 
 
418 aa  177  5e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.244888 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1284  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  29.43 
 
 
435 aa  177  5e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.788956 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1466  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  32.91 
 
 
422 aa  177  5e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000773  putative integral membrane protein  30.79 
 
 
418 aa  176  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0198  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.4 
 
 
451 aa  174  2.9999999999999996e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2931  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.92 
 
 
431 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1148  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  29.41 
 
 
449 aa  168  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3366  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  26.7 
 
 
457 aa  164  3e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2844  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  27.82 
 
 
465 aa  164  4.0000000000000004e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00523394  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2662  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  26.86 
 
 
423 aa  162  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000135742  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2009  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  27.69 
 
 
419 aa  163  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000139362  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1410  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.13 
 
 
431 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3550  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.4 
 
 
419 aa  163  1e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2981  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  26.86 
 
 
423 aa  162  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000155452  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0388  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  27.35 
 
 
448 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0378  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  27.35 
 
 
448 aa  159  1e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0824  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.32 
 
 
418 aa  157  6e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2691  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  26.77 
 
 
463 aa  152  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.432486 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1735  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  27.81 
 
 
466 aa  153  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2583  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  26.77 
 
 
463 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2483  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  26.77 
 
 
463 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00516243  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2571  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  26.77 
 
 
463 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.813648 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2528  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  26.77 
 
 
463 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.544769  normal  0.25931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2489  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  27.86 
 
 
440 aa  151  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3190  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  28.12 
 
 
424 aa  151  3e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0503  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.19 
 
 
423 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0491  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  27.94 
 
 
423 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0780  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  26.99 
 
 
457 aa  148  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0622255  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0633  putative PTS system, sugar-specific IIC component  25.46 
 
 
462 aa  148  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.2305 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0170  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  27.25 
 
 
489 aa  145  2e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.253864  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0238  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  25.6 
 
 
424 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2256  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  24.66 
 
 
455 aa  138  3.0000000000000003e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.23514  hitchhiker  0.000139154 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1954  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  26.2 
 
 
445 aa  134  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2250  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  25.82 
 
 
445 aa  127  7e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280391  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl643  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  27.19 
 
 
502 aa  126  9e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0590  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  24.9 
 
 
602 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4652  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  54.26 
 
 
99 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4745  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  54.26 
 
 
101 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4802  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  54.26 
 
 
101 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845098  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4662  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  54.26 
 
 
101 aa  113  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.833676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04061  L-ascorbate-specific enzyme IIB component of PTS  54.26 
 
 
101 aa  113  9e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04023  hypothetical protein  54.26 
 
 
101 aa  113  9e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5710  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  54.26 
 
 
101 aa  113  9e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3799  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  54.26 
 
 
101 aa  113  9e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1264  PTS system, IIBC component family protein  26.2 
 
 
510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1785  putative sugar-specific permease, SgaT/UlaA  23.13 
 
 
425 aa  113  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0113984 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4438  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  54.26 
 
 
101 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3819  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  54.26 
 
 
101 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4665  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  54.26 
 
 
101 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4724  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  54.26 
 
 
101 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2087  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  23.63 
 
 
425 aa  109  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.51503  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0143  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  42.65 
 
 
92 aa  69.7  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.152358  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1814  PTS system, IIB component  36.26 
 
 
92 aa  65.1  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1322  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  43.59 
 
 
93 aa  56.2  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0209  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  33.33 
 
 
90 aa  53.5  0.00001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0123  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  32.56 
 
 
94 aa  51.6  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3751  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  38.98 
 
 
91 aa  47.8  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0646  putative PTS system, ascorbate-specific IIB component SgaB  30.38 
 
 
96 aa  47  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0989  putative inner membrane protein  28.12 
 
 
106 aa  46.6  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2010  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  33.33 
 
 
89 aa  45.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000312148  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2663  sugar phosphotransferase component II B  30.11 
 
 
89 aa  45.4  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.168546  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0490  penitol PTS system enzyem IIB component  27.96 
 
 
90 aa  43.9  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>