73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1466 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1466  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  100 
 
 
422 aa  823    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2981  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  48.81 
 
 
423 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000155452  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1546  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  48.67 
 
 
418 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111048  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2662  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  48.81 
 
 
423 aa  414  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000135742  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1437  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  48.67 
 
 
418 aa  414  1e-114  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000156476  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0344  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  48.43 
 
 
418 aa  410  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000119572  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3366  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  46.9 
 
 
457 aa  404  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0780  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  47.72 
 
 
457 aa  399  9.999999999999999e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0622255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2009  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  49.03 
 
 
419 aa  396  1e-109  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000139362  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000773  putative integral membrane protein  46 
 
 
418 aa  393  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2844  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  47.02 
 
 
465 aa  386  1e-106  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00523394  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1148  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  46.81 
 
 
449 aa  384  1e-105  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20180  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  46.9 
 
 
421 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3550  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  46.62 
 
 
419 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2055  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  45.28 
 
 
418 aa  379  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.244888 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0198  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  46.62 
 
 
451 aa  376  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2583  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  46.73 
 
 
463 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2528  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  46.73 
 
 
463 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.544769  normal  0.25931 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0388  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  46.48 
 
 
448 aa  368  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2691  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  46.73 
 
 
463 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.432486 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2483  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  46.73 
 
 
463 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00516243  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2571  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  46.73 
 
 
463 aa  368  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.813648 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0378  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  46.48 
 
 
448 aa  368  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1735  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  45.93 
 
 
466 aa  355  5.999999999999999e-97  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0824  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  44.96 
 
 
418 aa  348  9e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1954  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  42.58 
 
 
445 aa  342  7e-93  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1284  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  41.65 
 
 
435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.788956 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2256  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  41.02 
 
 
455 aa  327  3e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.23514  hitchhiker  0.000139154 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2250  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  43.31 
 
 
445 aa  327  3e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280391  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2931  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  40.32 
 
 
431 aa  295  9e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1410  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  41.36 
 
 
431 aa  294  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0170  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  40.98 
 
 
489 aa  293  4e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.253864  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3190  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  40.54 
 
 
424 aa  283  5.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0238  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  37.53 
 
 
424 aa  276  6e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0633  putative PTS system, sugar-specific IIC component  35.97 
 
 
462 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.2305 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2489  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  37.24 
 
 
440 aa  269  7e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1264  PTS system, IIBC component family protein  39.75 
 
 
510 aa  266  5.999999999999999e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1785  putative sugar-specific permease, SgaT/UlaA  31.72 
 
 
425 aa  231  2e-59  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0113984 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0590  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  37.81 
 
 
602 aa  230  3e-59  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl643  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.39 
 
 
502 aa  230  5e-59  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2087  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  30.99 
 
 
425 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.51503  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0491  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  33.68 
 
 
423 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0503  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  33.68 
 
 
423 aa  207  4e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0132  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  34.49 
 
 
443 aa  193  4e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0118  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  34.43 
 
 
587 aa  188  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3499  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0983  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  32.66 
 
 
586 aa  186  8e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4753  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  34.45 
 
 
465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04060  ascorbate-specific PTS system enzyme IIC  34.45 
 
 
465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4437  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  34.45 
 
 
465 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3820  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  34.45 
 
 
465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4664  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  34.45 
 
 
465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04022  hypothetical protein  34.45 
 
 
465 aa  181  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3800  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  34.45 
 
 
465 aa  180  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0289  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  32.69 
 
 
581 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4651  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  34.45 
 
 
465 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4801  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  34.45 
 
 
465 aa  179  8e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5709  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  33.93 
 
 
465 aa  177  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4661  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  33.93 
 
 
465 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4780  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  33.93 
 
 
465 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4744  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  33.93 
 
 
465 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0124  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  28.86 
 
 
471 aa  166  5e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1016  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  31.11 
 
 
447 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.279058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0921  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.33 
 
 
447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1018  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.33 
 
 
447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.857489  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0956  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.33 
 
 
447 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1037  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.33 
 
 
447 aa  163  7e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0988  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.08 
 
 
447 aa  159  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0142  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  28.8 
 
 
474 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010128  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1323  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  31.45 
 
 
485 aa  151  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0645  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.93 
 
 
488 aa  147  5e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.354005  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1815  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.13 
 
 
479 aa  136  7.000000000000001e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00193674  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0326  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.67 
 
 
503 aa  119  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1996  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.16 
 
 
503 aa  114  4.0000000000000004e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>