73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0491 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0503  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  99.05 
 
 		 423 aa  813    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0491  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  100 
 
 		 423 aa  822    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0388  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.64 
 
 		 448 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0378  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.64 
 
 		 448 aa  261  1e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2931  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  37.33 
 
 		 431 aa  256  5e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3366  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  33.18 
 
 		 457 aa  252  1e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0780  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  35.07 
 
 		 457 aa  251  3e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0622255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1735  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  37.98 
 
 		 466 aa  249  5e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1410  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.8 
 
 		 431 aa  249  6e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2844  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36 
 
 		 465 aa  248  1e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00523394  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1148  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  38.1 
 
 		 449 aa  242  1e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1437  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.75 
 
 		 418 aa  239  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000156476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1546  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.75 
 
 		 418 aa  239  8e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111048  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0344  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.75 
 
 		 418 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000119572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2483  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  35.6 
 
 		 463 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00516243  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2528  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  35.6 
 
 		 463 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.544769  normal  0.25931 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2583  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  35.6 
 
 		 463 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2571  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  35.6 
 
 		 463 aa  237  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.813648 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2981  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  35.44 
 
 		 423 aa  237  3e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000155452  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2662  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  34.95 
 
 		 423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000135742  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000773  putative integral membrane protein  35.09 
 
 		 418 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2691  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  35.13 
 
 		 463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.432486 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0198  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  35.97 
 
 		 451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2055  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.72 
 
 		 418 aa  233  5e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.244888 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2009  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  33.65 
 
 		 419 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000139362  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0238  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  32.07 
 
 		 424 aa  225  1e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2489  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  33.24 
 
 		 440 aa  223  4e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3550  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.08 
 
 		 419 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20180  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  34.04 
 
 		 421 aa  219  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3190  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  32.75 
 
 		 424 aa  210  3e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0633  putative PTS system, sugar-specific IIC component  32.08 
 
 		 462 aa  207  2e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.2305 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0824  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  32.12 
 
 		 418 aa  207  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2256  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  32.39 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.23514  hitchhiker  0.000139154 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1466  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  33.68 
 
 		 422 aa  200  3e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1954  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  31.02 
 
 		 445 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2250  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  32.89 
 
 		 445 aa  193  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280391  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0590  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  34.37 
 
 		 602 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1785  putative sugar-specific permease, SgaT/UlaA  29.07 
 
 		 425 aa  180  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0113984 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2087  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  29.07 
 
 		 425 aa  179  5.999999999999999e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.51503  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0170  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  29.62 
 
 		 489 aa  173  3.9999999999999995e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.253864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1264  PTS system, IIBC component family protein  33.62 
 
 		 510 aa  169  6e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1284  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  30.15 
 
 		 435 aa  160  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.788956 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0118  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  27.18 
 
 		 587 aa  146  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3499  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0124  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  32.14 
 
 		 471 aa  144  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0983  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  27.74 
 
 		 586 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5709  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.89 
 
 		 465 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0289  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  28.09 
 
 		 581 aa  139  1e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0132  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  27.43 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3800  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  29.72 
 
 		 465 aa  137  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl643  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.53 
 
 		 502 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04060  ascorbate-specific PTS system enzyme IIC  29.89 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4437  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.72 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4753  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.89 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3820  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.89 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4664  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.89 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04022  hypothetical protein  29.89 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4661  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.46 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4780  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.46 
 
 		 465 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4744  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.26 
 
 		 465 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4801  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.46 
 
 		 465 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4651  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.46 
 
 		 465 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1018  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.6 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.857489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0956  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.6 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0921  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.6 
 
 		 447 aa  135  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433229  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0988  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.6 
 
 		 447 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1323  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  28.47 
 
 		 485 aa  135  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1016  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.98 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.279058 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0142  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  28.18 
 
 		 474 aa  134  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010128  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1037  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.6 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1815  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.01 
 
 		 479 aa  133  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00193674  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0645  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  26.65 
 
 		 488 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.354005  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0326  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  27.78 
 
 		 503 aa  121  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1996  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  27.79 
 
 		 503 aa  113  7.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>