73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0645 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0645  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  100 
 
 		 488 aa  974    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.354005  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0142  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  58.09 
 
 		 474 aa  556  1e-157  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010128  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0124  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  55.44 
 
 		 471 aa  542  1e-153  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0326  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  54.67 
 
 		 503 aa  538  9.999999999999999e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1996  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  56.25 
 
 		 503 aa  530  1e-149  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1323  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  56.79 
 
 		 485 aa  521  1e-147  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1815  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  53.63 
 
 		 479 aa  447  1.0000000000000001e-124  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00193674  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0983  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  39.51 
 
 		 586 aa  342  5.999999999999999e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0118  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  40.88 
 
 		 587 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3499  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0289  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  40 
 
 		 581 aa  322  8e-87  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4780  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  37.14 
 
 		 465 aa  313  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4661  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  37.14 
 
 		 465 aa  313  4.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04060  ascorbate-specific PTS system enzyme IIC  37.14 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4664  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  37.14 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04022  hypothetical protein  37.14 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4753  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  37.14 
 
 		 465 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4801  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.93 
 
 		 465 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3820  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.93 
 
 		 465 aa  311  2e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4651  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.93 
 
 		 465 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4437  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.93 
 
 		 465 aa  311  2e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4744  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.93 
 
 		 465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3800  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  36.93 
 
 		 465 aa  310  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5709  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.93 
 
 		 465 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0132  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  36.71 
 
 		 443 aa  295  2e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0988  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.92 
 
 		 447 aa  267  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1037  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.94 
 
 		 447 aa  266  5.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0921  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.68 
 
 		 447 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433229  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0956  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.68 
 
 		 447 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1018  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.68 
 
 		 447 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.857489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1016  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.64 
 
 		 447 aa  266  8.999999999999999e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.279058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2931  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.57 
 
 		 431 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1410  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.43 
 
 		 431 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2844  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.43 
 
 		 465 aa  164  5.0000000000000005e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00523394  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0198  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  31.19 
 
 		 451 aa  163  7e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20180  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  31.92 
 
 		 421 aa  163  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1437  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.25 
 
 		 418 aa  163  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000156476  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1546  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.25 
 
 		 418 aa  163  8.000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111048  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0344  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.25 
 
 		 418 aa  162  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000119572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3366  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  28.64 
 
 		 457 aa  160  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2489  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  29.98 
 
 		 440 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2981  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.11 
 
 		 423 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000155452  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2009  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.5 
 
 		 419 aa  156  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000139362  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2662  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  27.88 
 
 		 423 aa  155  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000135742  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1148  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  29.23 
 
 		 449 aa  156  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2571  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.36 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.813648 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2483  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.36 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00516243  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2583  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.36 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2528  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.36 
 
 		 463 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.544769  normal  0.25931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2055  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.57 
 
 		 418 aa  154  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.244888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2691  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.14 
 
 		 463 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.432486 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000773  putative integral membrane protein  28.64 
 
 		 418 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1264  PTS system, IIBC component family protein  27.2 
 
 		 510 aa  147  4.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3550  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  27.48 
 
 		 419 aa  145  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1735  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  27.95 
 
 		 466 aa  145  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0824  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.79 
 
 		 418 aa  144  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0780  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  26.58 
 
 		 457 aa  143  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0622255  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1466  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  30.27 
 
 		 422 aa  141  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0388  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.01 
 
 		 448 aa  136  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0378  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.01 
 
 		 448 aa  136  7.000000000000001e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1284  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  29.43 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.788956 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3190  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  29.19 
 
 		 424 aa  131  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0491  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  26.71 
 
 		 423 aa  131  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0238  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.33 
 
 		 424 aa  131  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl643  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.62 
 
 		 502 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0503  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  26.27 
 
 		 423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0590  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  31.12 
 
 		 602 aa  126  8.000000000000001e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2256  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  25.06 
 
 		 455 aa  117  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.23514  hitchhiker  0.000139154 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0633  putative PTS system, sugar-specific IIC component  25.37 
 
 		 462 aa  117  5e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.2305 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0170  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  27.93 
 
 		 489 aa  117  5e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.253864  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1954  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  24.25 
 
 		 445 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2250  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  24.02 
 
 		 445 aa  105  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280391  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1785  putative sugar-specific permease, SgaT/UlaA  25.12 
 
 		 425 aa  88.2  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0113984 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2087  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  22.76 
 
 		 425 aa  88.2  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.51503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>