73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_04060 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_4753  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  100 
 
 		 465 aa  935    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4780  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  98.06 
 
 		 465 aa  923    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.259071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4661  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  98.06 
 
 		 465 aa  923    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4651  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  98.49 
 
 		 465 aa  925    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04060  ascorbate-specific PTS system enzyme IIC  100 
 
 		 465 aa  935    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4801  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  98.49 
 
 		 465 aa  925    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5709  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  99.57 
 
 		 465 aa  929    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4744  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  97.85 
 
 		 465 aa  896    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4664  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  100 
 
 		 465 aa  935    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3820  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  99.78 
 
 		 465 aa  934    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00675829 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4437  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  99.78 
 
 		 465 aa  934    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04022  hypothetical protein  100 
 
 		 465 aa  935    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3800  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  99.78 
 
 		 465 aa  933    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0983  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  65.37 
 
 		 586 aa  617  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0118  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  63.82 
 
 		 587 aa  593  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3499  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0289  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  64.35 
 
 		 581 aa  585  1e-166  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0132  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  37.7 
 
 		 443 aa  324  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0645  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  37.14 
 
 		 488 aa  312  5.999999999999999e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.354005  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0124  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  36.38 
 
 		 471 aa  312  6.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1815  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  41.65 
 
 		 479 aa  310  2e-83  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00193674  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0142  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  39.47 
 
 		 474 aa  311  2e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010128  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1016  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  38.89 
 
 		 447 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.279058 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0921  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  38.19 
 
 		 447 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.433229  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1018  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  38.19 
 
 		 447 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.857489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0956  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  38.19 
 
 		 447 aa  306  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1037  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  37.96 
 
 		 447 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0988  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  37.96 
 
 		 447 aa  301  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.779064  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1323  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  35.04 
 
 		 485 aa  298  1e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0326  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  36.76 
 
 		 503 aa  283  7.000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1996  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  34.16 
 
 		 503 aa  230  4e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1148  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  31.52 
 
 		 449 aa  192  8e-48  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1546  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.9 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000111048  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1437  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.9 
 
 		 418 aa  187  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000156476  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2844  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.51 
 
 		 465 aa  187  5e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00523394  normal  0.505448 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1466  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  34.45 
 
 		 422 aa  187  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0198  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.75 
 
 		 451 aa  186  6e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0344  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.9 
 
 		 418 aa  186  1.0000000000000001e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000119572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20180  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  30.63 
 
 		 421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1410  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  33.86 
 
 		 431 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2931  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  33.51 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2055  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.95 
 
 		 418 aa  183  5.0000000000000004e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.244888 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000773  putative integral membrane protein  30.05 
 
 		 418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2691  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  27.83 
 
 		 463 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.432486 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2571  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  27.83 
 
 		 463 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.813648 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2483  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  27.83 
 
 		 463 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00516243  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3366  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  27.99 
 
 		 457 aa  179  5.999999999999999e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2583  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  27.83 
 
 		 463 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2528  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  27.83 
 
 		 463 aa  179  7e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.544769  normal  0.25931 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2489  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  31.58 
 
 		 440 aa  178  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1735  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  30.33 
 
 		 466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0780  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.72 
 
 		 457 aa  172  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0622255  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0388  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.76 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0378  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.76 
 
 		 448 aa  171  2e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3550  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.22 
 
 		 419 aa  170  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2009  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.61 
 
 		 419 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000139362  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1954  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.18 
 
 		 445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2662  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.35 
 
 		 423 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000135742  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2981  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.61 
 
 		 423 aa  164  3e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000155452  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2256  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  27.69 
 
 		 455 aa  163  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.23514  hitchhiker  0.000139154 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1284  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  28.05 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.788956 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0238  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.87 
 
 		 424 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0824  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.43 
 
 		 418 aa  162  2e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.268648  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2250  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.17 
 
 		 445 aa  157  4e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.280391  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0170  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  30.7 
 
 		 489 aa  156  7e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.253864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0633  putative PTS system, sugar-specific IIC component  26.05 
 
 		 462 aa  154  2.9999999999999998e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.2305 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0491  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.89 
 
 		 423 aa  153  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3190  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  30.56 
 
 		 424 aa  153  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0503  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  29.89 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1785  putative sugar-specific permease, SgaT/UlaA  27.1 
 
 		 425 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0113984 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl643  PTS system ascorbate-specific transporter subunit IIC  28.17 
 
 		 502 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2087  putative sugar-specific permease SgaT/UlaA  26.44 
 
 		 425 aa  127  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.51503  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0590  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  31.7 
 
 		 602 aa  123  7e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1264  PTS system, IIBC component family protein  27.39 
 
 		 510 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00313074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>