26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0989 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0989  putative inner membrane protein  100 
 
 		 106 aa  217  3.9999999999999997e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0131  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  43.27 
 
 		 106 aa  97.1  7e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0289  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  28.87 
 
 		 581 aa  49.3  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0983  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  28.12 
 
 		 586 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4652  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  26 
 
 		 99 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1736  phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component  28.87 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.251626  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4662  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  26.26 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.833676  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4745  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  26.26 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4802  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  26.26 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845098  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1814  PTS system, IIB component  29.03 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3799  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  25.25 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04023  hypothetical protein  25.25 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5710  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  25.25 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0823  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  31.4 
 
 		 89 aa  45.1  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.479852  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04061  L-ascorbate-specific enzyme IIB component of PTS  25.25 
 
 		 101 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4724  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  25.25 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4665  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  25.25 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3819  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  25.25 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2257  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  27.78 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.74172  hitchhiker  0.0000885847 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4438  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  25.25 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0118  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  24.74 
 
 		 587 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3499  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1266  PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  32.18 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0104211 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1149  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  35.94 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0779  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  35.71 
 
 		 90 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.897139  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2056  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  27.5 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.615056  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2845  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  28.09 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0026966  normal  0.681011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>