40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A4745 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011149  SeAg_B4662  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  100 
 
 		 101 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.833676  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4802  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  100 
 
 		 101 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4745  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  100 
 
 		 101 aa  209  1e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04061  L-ascorbate-specific enzyme IIB component of PTS  99.01 
 
 		 101 aa  208  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04023  hypothetical protein  99.01 
 
 		 101 aa  208  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5710  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  99.01 
 
 		 101 aa  208  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3799  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  99.01 
 
 		 101 aa  208  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4438  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  98.02 
 
 		 101 aa  206  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3819  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  98.02 
 
 		 101 aa  206  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4665  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  98.02 
 
 		 101 aa  206  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4724  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  98.02 
 
 		 101 aa  206  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4652  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  100 
 
 		 99 aa  203  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0289  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  57.45 
 
 		 581 aa  117  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0983  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  54.26 
 
 		 586 aa  113  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0118  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  54.35 
 
 		 587 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3499  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0143  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  54.84 
 
 		 92 aa  72  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.152358  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1322  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  47.67 
 
 		 93 aa  69.3  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1814  PTS system, IIB component  38.71 
 
 		 92 aa  67  0.00000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0123  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  33.72 
 
 		 94 aa  63.5  0.0000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0131  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  36.27 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0646  putative PTS system, ascorbate-specific IIB component SgaB  32.5 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0209  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  29.89 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0823  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  32.58 
 
 		 89 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.479852  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0239  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  30.68 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0327  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  32.99 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0989  putative inner membrane protein  26.26 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1409  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  28.28 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3189  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  33.33 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.728848  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3751  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  27.17 
 
 		 91 aa  44.3  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2490  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  30.68 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206391  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2663  sugar phosphotransferase component II B  32.94 
 
 		 89 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.168546  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0490  penitol PTS system enzyem IIB component  30.53 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0502  PTS system, lactose/cellobiose-specific IIB component  29.67 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.191208  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2982  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  31.76 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000466045  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1266  PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  32.31 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0104211 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2010  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  32.94 
 
 		 89 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000312148  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04132  hypothetical protein  33.33 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3695  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  33.33 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04170  predicted enzyme IIB component of PTS  33.33 
 
 		 92 aa  40.8  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0151  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  31.08 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>