58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0646 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0646  putative PTS system, ascorbate-specific IIB component SgaB  100 
 
 		 96 aa  188  2e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0123  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  58.43 
 
 		 94 aa  101  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0327  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  41.11 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1995  phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component  40.66 
 
 		 101 aa  76.3  0.0000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0143  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  45.59 
 
 		 92 aa  69.7  0.00000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.152358  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1814  PTS system, IIB component  42.39 
 
 		 92 aa  67.8  0.00000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1322  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  46.59 
 
 		 93 aa  63.5  0.0000000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04023  hypothetical protein  31.52 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3799  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  31.52 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5710  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  31.52 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4662  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  31.52 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.833676  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4652  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  31.52 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4802  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  31.52 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4745  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  31.52 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4724  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  31.52 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4665  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  31.52 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3819  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  31.52 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492888 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4438  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  31.52 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04061  L-ascorbate-specific enzyme IIB component of PTS  31.52 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2751  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  36.67 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0267952  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0239  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  32.61 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2490  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  35.71 
 
 		 89 aa  55.5  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206391  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2251  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  40 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.470891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2663  sugar phosphotransferase component II B  32.98 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.168546  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2010  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  30.85 
 
 		 89 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000312148  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0590  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  31.87 
 
 		 602 aa  53.1  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1955  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  38.14 
 
 		 97 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.876388  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0289  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  26.97 
 
 		 581 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0118  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  27.37 
 
 		 587 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2982  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  30.85 
 
 		 89 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000466045  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0983  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  27.66 
 
 		 586 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2257  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  37.23 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.74172  hitchhiker  0.0000885847 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0209  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  35.16 
 
 		 90 aa  50.4  0.000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0379  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  28.72 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0389  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  28.72 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1465  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  29.21 
 
 		 94 aa  49.7  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1409  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  27.66 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661644  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2572  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  38.46 
 
 		 90 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0697836  normal  0.670538 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2584  PTS system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  38.46 
 
 		 90 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.267294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2692  PTS system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  38.46 
 
 		 90 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.621712 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2845  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  40.43 
 
 		 90 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0026966  normal  0.681011 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2529  PTS system lactose/cellobiose-specific transporter subunit IIB  38.46 
 
 		 90 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0712535  normal  0.400159 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2484  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  38.46 
 
 		 90 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000665706  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3367  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  27.27 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0343  PTS system lactose/cellobiose-specific transporter subunit IIB  27.27 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000259876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1547  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  27.27 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00223211  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1438  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  27.27 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000114566  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0197  PTS system, IIB component, putative  38.89 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3549  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  27.27 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0779  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  28.89 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.897139  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3189  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  29.79 
 
 		 90 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.728848  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0823  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  26.97 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.479852  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2932  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  29 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000772  hypothetical protein  37.21 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1149  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  26.09 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1266  PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  26.19 
 
 		 89 aa  41.6  0.004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0104211 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2056  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  32.56 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.615056  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0171  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  27.78 
 
 		 94 aa  40.8  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.430565  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>