30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0327 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0327  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  100 
 
 		 102 aa  210  5.999999999999999e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1995  phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component  51.55 
 
 		 101 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2751  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  39.39 
 
 		 100 aa  77.8  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0267952  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0646  putative PTS system, ascorbate-specific IIB component SgaB  40 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0123  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  38.04 
 
 		 94 aa  57.4  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1322  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  38.04 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0823  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  40.45 
 
 		 89 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.479852  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1814  PTS system, IIB component  33.33 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4802  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  32.99 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4662  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  32.99 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.833676  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4652  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  32.99 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4745  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  32.99 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4724  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  32.99 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3799  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  32.99 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04023  hypothetical protein  32.99 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5710  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  32.99 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4438  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  32.99 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04061  L-ascorbate-specific enzyme IIB component of PTS  32.99 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3819  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  32.99 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4665  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  32.99 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0209  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  32.26 
 
 		 90 aa  47  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0143  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  33.85 
 
 		 92 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.152358  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2010  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  28.89 
 
 		 89 aa  43.9  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000312148  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0171  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  34.07 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.430565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2251  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  34.07 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.470891  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2257  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  33.33 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.74172  hitchhiker  0.0000885847 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1955  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  35.16 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.876388  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2982  PTS system, lactose/cellobiose specific IIB subunit  27.78 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000466045  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0389  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  30.77 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0379  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  30.77 
 
 		 94 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>