58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3695 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04170  predicted enzyme IIB component of PTS  100 
 
 		 92 aa  187  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3695  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  100 
 
 		 92 aa  187  5.999999999999999e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04132  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  187  5.999999999999999e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1548  PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  93.48 
 
 		 93 aa  176  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1730  PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  93.48 
 
 		 93 aa  176  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1791  PTS system Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  93.48 
 
 		 93 aa  176  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00423056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1727  PTS system lactose/cellobiose-specific transporter subunit IIB  93.48 
 
 		 93 aa  176  9e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1729  PTS system lactose/cellobiose-specific transporter subunit IIB  92.39 
 
 		 93 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0436127  normal  0.448527 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3751  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  51.65 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0033  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  38.46 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3387  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  39.56 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000879799  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1143  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  38.89 
 
 		 94 aa  68.2  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0237  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  37.21 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0231  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  37.21 
 
 		 92 aa  65.9  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3554  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  35.56 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.306895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3446  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  35.56 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3517  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  35.56 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3614  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  35.56 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.188912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3448  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  35.56 
 
 		 94 aa  64.7  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.605443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4824  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIB component  31.46 
 
 		 93 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0971  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  35.56 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.366549 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3072  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  35.56 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3768  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIB component  30.34 
 
 		 93 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01985  hypothetical protein  35.56 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1554  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  35.56 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2381  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  34.44 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2229  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  35.56 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.691967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02019  galactitol-specific enzyme IIB component of PTS  35.56 
 
 		 94 aa  62  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4009  putative IIB component of PTS system  30.34 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4114  PTS system IIB component  30.34 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3993  putative IIB component of PTS system  30.34 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.971949  normal  0.466757 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4064  putative PTS system transporter subunit IIB  30.34 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.801033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1145  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  34.44 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.274258  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1646  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  34.41 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000317921 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0151  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  31.52 
 
 		 93 aa  56.6  0.0000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4121  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  32.61 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251352  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0215  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  35.11 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3261  PTS system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  38.89 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.340834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3158  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  32.58 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2221  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  31.52 
 
 		 95 aa  54.7  0.0000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0122  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 108 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000835049  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1641  PTS system, galactitol-specific IIB component, putative  35.48 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408521  hitchhiker  0.00362196 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0236  phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component  29.35 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09230  phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component  28.26 
 
 		 102 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1733  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  31.11 
 
 		 92 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3722  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  34.21 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000348098  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04061  L-ascorbate-specific enzyme IIB component of PTS  27.27 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3799  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  27.27 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4438  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  27.27 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04023  hypothetical protein  27.27 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5710  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  27.27 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3819  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  27.27 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00492888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4665  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  27.27 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4724  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  27.27 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4745  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  33.33 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4662  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  33.33 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.833676  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4802  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  33.33 
 
 		 101 aa  40.8  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4652  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  33.33 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>