66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3751 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3751  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  100 
 
 
91 aa  179  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04132  hypothetical protein  51.65 
 
 
92 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3695  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  51.65 
 
 
92 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04170  predicted enzyme IIB component of PTS  51.65 
 
 
92 aa  97.1  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1791  PTS system Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  51.65 
 
 
93 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00423056  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1548  PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  51.65 
 
 
93 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1730  PTS system, Lactose/Cellobiose specific IIB subunit  51.65 
 
 
93 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1727  PTS system lactose/cellobiose-specific transporter subunit IIB  51.65 
 
 
93 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542593  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1729  PTS system lactose/cellobiose-specific transporter subunit IIB  50.55 
 
 
93 aa  95.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0436127  normal  0.448527 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0033  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  44.44 
 
 
94 aa  85.5  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3387  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  41.76 
 
 
92 aa  67.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000879799  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0237  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  39.08 
 
 
92 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0231  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  39.08 
 
 
92 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3517  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  38.89 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.210683  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3614  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  38.89 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.188912  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3448  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  38.89 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.605443  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3554  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  38.89 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.306895  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3446  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  38.89 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4121  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  37.21 
 
 
95 aa  65.5  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.251352  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1143  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  37.78 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3072  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  38.46 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248985 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0971  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  38.46 
 
 
94 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.366549 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1554  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  38.46 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1145  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  38.46 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.274258  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2381  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  37.36 
 
 
94 aa  62  0.000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2229  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIB  38.46 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.691967  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0151  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  33.7 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01985  hypothetical protein  38.46 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02019  galactitol-specific enzyme IIB component of PTS  38.46 
 
 
94 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3722  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  35.23 
 
 
99 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000348098  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3993  putative IIB component of PTS system  33.71 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.971949  normal  0.466757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4009  putative IIB component of PTS system  33.71 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4064  putative PTS system transporter subunit IIB  33.71 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.801033  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4114  PTS system IIB component  33.71 
 
 
95 aa  61.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3768  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIB component  33.71 
 
 
93 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1646  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  35.87 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000317921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4824  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIB component  33.71 
 
 
93 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0215  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  37.23 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2221  phosphotransferase system, lactose/cellobiose-specific IIB subunit  35.8 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.99105 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3158  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  34.83 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0122  response regulator receiver protein  30.77 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000835049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1733  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  35.16 
 
 
92 aa  51.6  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1641  PTS system, galactitol-specific IIB component, putative  34.94 
 
 
94 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.408521  hitchhiker  0.00362196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3261  PTS system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  34.94 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.340834  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0236  phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component  30.11 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0983  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  38.98 
 
 
586 aa  47.8  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3369  transcriptional antiterminator, BglG  32.86 
 
 
687 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0118  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  33.33 
 
 
587 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.3499  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09230  phosphotransferase system, galactitol-specific IIB component  25.27 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0031  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  30 
 
 
90 aa  44.7  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4802  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  27.17 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.845098  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0289  PTS system ascorbate-specific transporter subunits IICB  31.67 
 
 
581 aa  44.7  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4662  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  27.17 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.833676  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4652  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  27.17 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4745  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  27.17 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4724  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  27.17 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4665  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  27.17 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3819  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  27.17 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00492888 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4438  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  27.17 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04023  hypothetical protein  27.17 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5710  PTS system L-ascorbate-specific transporter subunit IIB  27.17 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0143  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  32.31 
 
 
92 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.152358  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3799  phosphotransferase system lactose/cellobiose-specific IIB subunit  27.17 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04061  L-ascorbate-specific enzyme IIB component of PTS  27.17 
 
 
101 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0123  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  33.71 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1322  phosphotransferase system lactose/cellobiose- specific IIB subunit  35.63 
 
 
93 aa  43.5  0.0009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>