62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0642 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  483  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  43.41 
 
 		 212 aa  168  7e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000213  hypothetical protein  43.69 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  36.27 
 
 		 221 aa  85.1  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  35.85 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  37.57 
 
 		 220 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  37.57 
 
 		 231 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  34.81 
 
 		 212 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  35.84 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  32.81 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3872  YhhN family protein  27.94 
 
 		 208 aa  68.9  0.00000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  29.58 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  32.54 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3887  hypothetical protein  26.47 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3844  hypothetical protein  26.47 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3767  hypothetical protein  26.47 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3777  hypothetical protein  26.47 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3946  hypothetical protein  26.47 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00285  hypothetical protein  32.93 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  35.12 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  32.41 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002133  hypothetical protein  31.1 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  36.21 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  29.26 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3751  hypothetical protein  25.25 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3950  hypothetical protein  25.25 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0248  YhhN family protein  25.25 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3854  hypothetical protein  25.25 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.85502  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0247  YhhN family protein  25.25 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4788  hypothetical protein  25.25 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03270  hypothetical protein  25.25 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03317  conserved inner membrane protein  25.25 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3667  hypothetical protein  24.75 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  32.16 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  36.62 
 
 		 626 aa  59.3  0.00000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  32.88 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  30.43 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1326  YhhN family protein  30.69 
 
 		 239 aa  58.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  31.15 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2377  hypothetical protein  31.2 
 
 		 209 aa  57  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.549446  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0212  YhhN family protein  32.28 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0075935 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0089  YhhN family protein  28.42 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3881  YhhN family protein  25 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  30.57 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  31.87 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  30.57 
 
 		 223 aa  48.9  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  32.88 
 
 		 597 aa  47  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  30.46 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1943  YhhN-like  29.22 
 
 		 217 aa  46.6  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132681 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  31.94 
 
 		 597 aa  45.8  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3891  hypothetical protein  30.43 
 
 		 214 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  31.69 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  31.69 
 
 		 252 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  31.69 
 
 		 215 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  28.83 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0585  YhhN family protein  28.27 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.255183  hitchhiker  0.00102122 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  33.64 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0094  YhhN family protein  26.6 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2683  YhhN family protein  29.76 
 
 		 244 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1642  YhhN family protein  21.74 
 
 		 371 aa  43.1  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.450211  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  31.33 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  28.22 
 
 		 254 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>