55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0516 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  100 
 
 		 230 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  40.61 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  34.18 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  33.87 
 
 		 225 aa  74.3  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0585  YhhN family protein  37.1 
 
 		 221 aa  73.2  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.255183  hitchhiker  0.00102122 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  35.33 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  32.86 
 
 		 234 aa  72  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  40.25 
 
 		 221 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  32.47 
 
 		 236 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  36.18 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  32.28 
 
 		 223 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  32.65 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  32.47 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  31.9 
 
 		 246 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  32.52 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  32.52 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  32.52 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  36.31 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  29.19 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  35.17 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  30.71 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3734  YhhN family protein  35.88 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175923  normal  0.0451389 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1271  hypothetical protein  35.37 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1348  hypothetical protein  35.06 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0288  hypothetical protein  35.37 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1305  hypothetical protein  35.37 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1010  hypothetical protein  35.37 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2527  hypothetical protein  35.37 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0557  hypothetical protein  35.37 
 
 		 216 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212207  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  36.59 
 
 		 239 aa  57  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000213  hypothetical protein  30.22 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1943  YhhN-like  33.74 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  34.78 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2683  YhhN family protein  35.48 
 
 		 244 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  33.59 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  37.59 
 
 		 626 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1449  YhhN family protein  42.16 
 
 		 219 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  34.93 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0209  YhhN family protein  33.5 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  31.9 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  31.9 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  33.52 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3891  hypothetical protein  33.12 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  35.26 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1326  YhhN family protein  31.95 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  26.55 
 
 		 216 aa  48.5  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  36.05 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  26.75 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1470  hypothetical protein  33.57 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  31.33 
 
 		 597 aa  45.8  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  33.12 
 
 		 214 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1642  YhhN family protein  25.64 
 
 		 371 aa  45.1  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.450211  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  30.67 
 
 		 597 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  26.45 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1057  hypothetical protein  33.33 
 
 		 143 aa  42.7  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>