52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5627 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  100 
 
 		 223 aa  425  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  98.21 
 
 		 246 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  98.21 
 
 		 246 aa  418  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  94.62 
 
 		 246 aa  407  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  94.17 
 
 		 223 aa  377  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  93.72 
 
 		 223 aa  372  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  80.72 
 
 		 223 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1348  hypothetical protein  63.43 
 
 		 216 aa  187  9e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2527  hypothetical protein  63.43 
 
 		 216 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1271  hypothetical protein  63.43 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0557  hypothetical protein  62.96 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212207  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0288  hypothetical protein  62.96 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1010  hypothetical protein  62.96 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1305  hypothetical protein  62.96 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1470  hypothetical protein  63.13 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  39.74 
 
 		 228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  43.21 
 
 		 236 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  43.04 
 
 		 254 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  43.04 
 
 		 254 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  41.36 
 
 		 253 aa  104  9e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  42.08 
 
 		 261 aa  97.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3734  YhhN family protein  40.24 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175923  normal  0.0451389 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  37.11 
 
 		 216 aa  87.8  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  40.74 
 
 		 252 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  40.74 
 
 		 252 aa  85.9  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  40.74 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2683  YhhN family protein  39.02 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  40.36 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  38.27 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  36.88 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5175  YhhN family protein  35.29 
 
 		 225 aa  65.1  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  29.07 
 
 		 225 aa  64.7  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  34.31 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  40.12 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  29.08 
 
 		 216 aa  62  0.000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0585  YhhN family protein  35.9 
 
 		 221 aa  61.6  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.255183  hitchhiker  0.00102122 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  28.93 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  35.26 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  30.65 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6802  YhhN family protein  37.66 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  37.64 
 
 		 626 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000213  hypothetical protein  37.39 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  28.72 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  35.54 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  30.46 
 
 		 245 aa  46.6  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2729  hypothetical protein  34.62 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000838492  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  33.33 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1943  YhhN-like  32.59 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132681 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  36.14 
 
 		 597 aa  42.4  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1916  YhhN-like  31.89 
 
 		 226 aa  42  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.10888  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  36.25 
 
 		 239 aa  42  0.007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4354  YhhN family protein  32.97 
 
 		 236 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.856008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>