51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3353 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  100 
 
 		 253 aa  486  1e-136  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  83.2 
 
 		 254 aa  351  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  82 
 
 		 254 aa  341  7e-93  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  55.8 
 
 		 228 aa  235  5.0000000000000005e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  56.25 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  49.14 
 
 		 261 aa  171  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3734  YhhN family protein  50.88 
 
 		 232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175923  normal  0.0451389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  52.83 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  52.83 
 
 		 252 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2683  YhhN family protein  52.17 
 
 		 244 aa  158  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  52.88 
 
 		 215 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  36.89 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  38.22 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  37.33 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  37.33 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  39.13 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1348  hypothetical protein  45 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1010  hypothetical protein  45 
 
 		 216 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.341116  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1305  hypothetical protein  45 
 
 		 216 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0288  hypothetical protein  45 
 
 		 216 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0105629  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0557  hypothetical protein  45 
 
 		 216 aa  91.3  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.212207  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2527  hypothetical protein  45 
 
 		 216 aa  90.9  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  39.13 
 
 		 223 aa  90.1  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1271  hypothetical protein  44.38 
 
 		 216 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1470  hypothetical protein  43.03 
 
 		 218 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  34.81 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  39.02 
 
 		 626 aa  71.6  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  38.42 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  32.34 
 
 		 225 aa  65.5  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  44.36 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  36.5 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  38.98 
 
 		 214 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  31.44 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  44.44 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  36.17 
 
 		 236 aa  62  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  43.7 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3891  hypothetical protein  31.89 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  37.28 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1943  YhhN-like  40.46 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.132681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1449  YhhN family protein  30.7 
 
 		 219 aa  52.4  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  30.97 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  32.81 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  31.41 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6802  YhhN family protein  34.94 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  31.25 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  35.76 
 
 		 202 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5175  YhhN family protein  27.5 
 
 		 225 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  32.17 
 
 		 597 aa  45.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4354  YhhN family protein  33.33 
 
 		 236 aa  43.5  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.856008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0209  YhhN family protein  34.56 
 
 		 210 aa  42.7  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.209682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  34.03 
 
 		 597 aa  42.7  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>