48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1129 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  100 
 
 
221 aa  423  1e-117  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  39.38 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1326  YhhN family protein  40.53 
 
 
239 aa  125  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1057  hypothetical protein  40.15 
 
 
143 aa  87.4  2e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  36.27 
 
 
245 aa  85.1  8e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3693  YhhN family protein  47.65 
 
 
597 aa  83.2  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.392021 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  36.95 
 
 
236 aa  81.6  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  48.99 
 
 
597 aa  80.1  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  41.5 
 
 
626 aa  80.5  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  36.59 
 
 
216 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  37.36 
 
 
212 aa  74.7  0.0000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  37.56 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  37.24 
 
 
220 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  36.07 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  37.09 
 
 
214 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  30.18 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  30.93 
 
 
225 aa  68.6  0.00000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0516  YhhN family protein  40.14 
 
 
230 aa  67  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.974934  normal  0.848002 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  29 
 
 
212 aa  61.6  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3891  hypothetical protein  36.69 
 
 
214 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356157  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  35.68 
 
 
228 aa  59.7  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  35.23 
 
 
246 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3223  YhhN family protein  32.93 
 
 
254 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11430  hypothetical protein  34.94 
 
 
261 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000025885  normal  0.377804 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  38.1 
 
 
223 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  39.16 
 
 
202 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3547  YhhN family protein  32.34 
 
 
254 aa  55.1  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.663596 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000213  hypothetical protein  30.23 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5627  YhhN family protein  32.96 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.172527  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4020  YhhN family protein  34.21 
 
 
223 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.222458  normal  0.65035 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3384  YhhN-like  33.9 
 
 
236 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444232  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  37.5 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2378  YhhN-like protein  32.39 
 
 
252 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2425  YhhN family protein  32.39 
 
 
252 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0283848  normal  0.252656 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2419  YhhN family protein  32.39 
 
 
215 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6802  YhhN family protein  33.54 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3353  hypothetical protein  34.93 
 
 
253 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3695  YhhN-like  32.22 
 
 
246 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0585  YhhN family protein  35.62 
 
 
221 aa  49.7  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.255183  hitchhiker  0.00102122 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4673  YhhN family protein  32.22 
 
 
246 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.371542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2683  YhhN family protein  31.47 
 
 
244 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3734  YhhN family protein  31.47 
 
 
232 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175923  normal  0.0451389 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0399  YhhN family protein  29.79 
 
 
226 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1449  YhhN family protein  38.79 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.574158  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  26.73 
 
 
216 aa  45.4  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1642  YhhN family protein  23.57 
 
 
371 aa  44.3  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.450211  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  25 
 
 
216 aa  42.7  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1348  hypothetical protein  36.81 
 
 
216 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>