43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05949 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  423  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000213  hypothetical protein  66.35 
 
 		 215 aa  268  5e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  43.41 
 
 		 245 aa  168  5e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1747  YhhN family protein  30.05 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.223188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4118  YhhN family protein  29.19 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.932957  normal  0.74951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3690  YhhN family protein  28.65 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2193  YhhN family protein  28.44 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1483  YhhN family protein  29.47 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.435637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1129  YhhN family protein  29 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4581  YhhN-like  28.5 
 
 		 214 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3847  YhhN-like  29.7 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  27.69 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0995  hypothetical protein  27.6 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3887  hypothetical protein  21.9 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3946  hypothetical protein  21.9 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3777  hypothetical protein  21.9 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3767  hypothetical protein  21.9 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3844  hypothetical protein  21.9 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3872  YhhN family protein  22.01 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1967  hypothetical protein  32.6 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3881  YhhN family protein  21.81 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3891  hypothetical protein  29.9 
 
 		 214 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.356157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1310  YhhN family protein  25.73 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3530  YhhN-like protein  28.04 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1972  hypothetical protein  32.04 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3510  YhhN family protein  26.92 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2377  hypothetical protein  25.33 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.549446  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0817  YhhN-like  26.43 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03270  hypothetical protein  20.67 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0500  YhhN family protein  29.53 
 
 		 597 aa  43.1  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.602107  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4788  hypothetical protein  20.67 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3950  hypothetical protein  20.67 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3854  hypothetical protein  20.67 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.85502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3751  hypothetical protein  20.67 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0248  YhhN family protein  20.67 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1232  YhhN family protein  28.87 
 
 		 626 aa  43.1  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.957464  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03317  conserved inner membrane protein  20.67 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0247  YhhN family protein  20.67 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4067  YhhN family protein  28.25 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.608466  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4525  YhhN family protein  28.14 
 
 		 223 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.288194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3667  hypothetical protein  20.19 
 
 		 208 aa  41.6  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002133  hypothetical protein  25.64 
 
 		 206 aa  41.6  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1146  membrane protein, YhhN-like  27.96 
 
 		 246 aa  41.6  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0652127  normal  0.214062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>