29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A3667 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_0247  YhhN family protein  99.52 
 
 
208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03270  hypothetical protein  99.52 
 
 
208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4788  hypothetical protein  99.52 
 
 
208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3854  hypothetical protein  99.52 
 
 
208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.85502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3751  hypothetical protein  99.52 
 
 
208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0248  YhhN family protein  99.52 
 
 
208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3950  hypothetical protein  99.52 
 
 
208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3667  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03317  conserved inner membrane protein  99.52 
 
 
208 aa  405  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3844  hypothetical protein  90.87 
 
 
208 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.996869  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3887  hypothetical protein  90.87 
 
 
208 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3767  hypothetical protein  90.87 
 
 
208 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3777  hypothetical protein  90.87 
 
 
208 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3946  hypothetical protein  90.87 
 
 
208 aa  370  1e-101  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.665772  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3872  YhhN family protein  85.58 
 
 
208 aa  357  7e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.149003  normal  0.191907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0212  YhhN family protein  67.79 
 
 
208 aa  230  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0075935 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0089  YhhN family protein  61.06 
 
 
209 aa  229  3e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0572  hypothetical protein  66.35 
 
 
208 aa  214  5.9999999999999996e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3984  YhhN family protein  66.35 
 
 
208 aa  214  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0094  YhhN family protein  61.06 
 
 
209 aa  213  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0234  hypothetical protein  65.87 
 
 
208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.674365  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3881  YhhN family protein  53.59 
 
 
209 aa  212  3.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0642  hypothetical protein  25.62 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002133  hypothetical protein  28.64 
 
 
206 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00285  hypothetical protein  26.34 
 
 
206 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2377  hypothetical protein  26.09 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.549446  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05949  hypothetical protein  21.9 
 
 
212 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0591  YhhN family protein  30.69 
 
 
202 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000213  hypothetical protein  26.6 
 
 
215 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>